Protein–RNA interactions for Protein: Q9H930

SP140L, Nuclear body protein SP140-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140LQ9H930 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SP140LQ9H930 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SP140LQ9H930 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP140LQ9H930 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SP140LQ9H930 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SP140LQ9H930 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SP140LQ9H930 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SP140LQ9H930 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SP140LQ9H930 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP140LQ9H930 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SP140LQ9H930 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP140LQ9H930 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP140LQ9H930 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SP140LQ9H930 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SP140LQ9H930 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SP140LQ9H930 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP140LQ9H930 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP140LQ9H930 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SP140LQ9H930 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SP140LQ9H930 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SP140LQ9H930 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP140LQ9H930 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SP140LQ9H930 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP140LQ9H930 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP140LQ9H930 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP140LQ9H930 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SP140LQ9H930 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SP140LQ9H930 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP140LQ9H930 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP140LQ9H930 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP140LQ9H930 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP140LQ9H930 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SP140LQ9H930 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP140LQ9H930 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SP140LQ9H930 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SP140LQ9H930 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP140LQ9H930 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP140LQ9H930 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP140LQ9H930 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SP140LQ9H930 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SP140LQ9H930 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP140LQ9H930 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP140LQ9H930 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP140LQ9H930 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP140LQ9H930 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SP140LQ9H930 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP140LQ9H930 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP140LQ9H930 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP140LQ9H930 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP140LQ9H930 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP140LQ9H930 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP140LQ9H930 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP140LQ9H930 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP140LQ9H930 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP140LQ9H930 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP140LQ9H930 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP140LQ9H930 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP140LQ9H930 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP140LQ9H930 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP140LQ9H930 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP140LQ9H930 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP140LQ9H930 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP140LQ9H930 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP140LQ9H930 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SP140LQ9H930 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SP140LQ9H930 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SP140LQ9H930 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SP140LQ9H930 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SP140LQ9H930 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SP140LQ9H930 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SP140LQ9H930 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SP140LQ9H930 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP140LQ9H930 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP140LQ9H930 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP140LQ9H930 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP140LQ9H930 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP140LQ9H930 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SP140LQ9H930 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SP140LQ9H930 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SP140LQ9H930 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SP140LQ9H930 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SP140LQ9H930 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP140LQ9H930 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP140LQ9H930 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP140LQ9H930 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SP140LQ9H930 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SP140LQ9H930 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SP140LQ9H930 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SP140LQ9H930 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SP140LQ9H930 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SP140LQ9H930 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SP140LQ9H930 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SP140LQ9H930 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SP140LQ9H930 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SP140LQ9H930 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SP140LQ9H930 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP140LQ9H930 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP140LQ9H930 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SP140LQ9H930 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SP140LQ9H930 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms