Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDCL3Q9H2J4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDCL3Q9H2J4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDCL3Q9H2J4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PDCL3Q9H2J4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDCL3Q9H2J4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDCL3Q9H2J4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDCL3Q9H2J4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDCL3Q9H2J4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDCL3Q9H2J4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDCL3Q9H2J4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDCL3Q9H2J4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDCL3Q9H2J4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDCL3Q9H2J4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDCL3Q9H2J4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDCL3Q9H2J4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PDCL3Q9H2J4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDCL3Q9H2J4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDCL3Q9H2J4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDCL3Q9H2J4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDCL3Q9H2J4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDCL3Q9H2J4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDCL3Q9H2J4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDCL3Q9H2J4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDCL3Q9H2J4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDCL3Q9H2J4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDCL3Q9H2J4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PDCL3Q9H2J4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDCL3Q9H2J4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDCL3Q9H2J4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDCL3Q9H2J4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDCL3Q9H2J4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PDCL3Q9H2J4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PDCL3Q9H2J4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
PDCL3Q9H2J4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDCL3Q9H2J4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
PDCL3Q9H2J4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDCL3Q9H2J4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDCL3Q9H2J4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDCL3Q9H2J4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDCL3Q9H2J4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDCL3Q9H2J4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDCL3Q9H2J4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDCL3Q9H2J4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDCL3Q9H2J4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDCL3Q9H2J4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDCL3Q9H2J4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDCL3Q9H2J4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDCL3Q9H2J4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PDCL3Q9H2J4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PDCL3Q9H2J4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDCL3Q9H2J4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDCL3Q9H2J4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDCL3Q9H2J4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDCL3Q9H2J4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDCL3Q9H2J4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDCL3Q9H2J4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDCL3Q9H2J4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDCL3Q9H2J4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDCL3Q9H2J4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDCL3Q9H2J4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDCL3Q9H2J4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDCL3Q9H2J4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PDCL3Q9H2J4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDCL3Q9H2J4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDCL3Q9H2J4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDCL3Q9H2J4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDCL3Q9H2J4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDCL3Q9H2J4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDCL3Q9H2J4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDCL3Q9H2J4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDCL3Q9H2J4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDCL3Q9H2J4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDCL3Q9H2J4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDCL3Q9H2J4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDCL3Q9H2J4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDCL3Q9H2J4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDCL3Q9H2J4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDCL3Q9H2J4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDCL3Q9H2J4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDCL3Q9H2J4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PDCL3Q9H2J4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDCL3Q9H2J4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDCL3Q9H2J4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDCL3Q9H2J4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDCL3Q9H2J4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDCL3Q9H2J4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDCL3Q9H2J4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDCL3Q9H2J4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDCL3Q9H2J4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDCL3Q9H2J4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDCL3Q9H2J4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PDCL3Q9H2J4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDCL3Q9H2J4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDCL3Q9H2J4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDCL3Q9H2J4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDCL3Q9H2J4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDCL3Q9H2J4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDCL3Q9H2J4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDCL3Q9H2J4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms