Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC13A1Q9BZW2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC13A1Q9BZW2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC13A1Q9BZW2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC13A1Q9BZW2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC13A1Q9BZW2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC13A1Q9BZW2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC13A1Q9BZW2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC13A1Q9BZW2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC13A1Q9BZW2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC13A1Q9BZW2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC13A1Q9BZW2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC13A1Q9BZW2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC13A1Q9BZW2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC13A1Q9BZW2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC13A1Q9BZW2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC13A1Q9BZW2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC13A1Q9BZW2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC13A1Q9BZW2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC13A1Q9BZW2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC13A1Q9BZW2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC13A1Q9BZW2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC13A1Q9BZW2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC13A1Q9BZW2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC13A1Q9BZW2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC13A1Q9BZW2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC13A1Q9BZW2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC13A1Q9BZW2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC13A1Q9BZW2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC13A1Q9BZW2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC13A1Q9BZW2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC13A1Q9BZW2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC13A1Q9BZW2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC13A1Q9BZW2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC13A1Q9BZW2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC13A1Q9BZW2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC13A1Q9BZW2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC13A1Q9BZW2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC13A1Q9BZW2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC13A1Q9BZW2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC13A1Q9BZW2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC13A1Q9BZW2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC13A1Q9BZW2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC13A1Q9BZW2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC13A1Q9BZW2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC13A1Q9BZW2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC13A1Q9BZW2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC13A1Q9BZW2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC13A1Q9BZW2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC13A1Q9BZW2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC13A1Q9BZW2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC13A1Q9BZW2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC13A1Q9BZW2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC13A1Q9BZW2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC13A1Q9BZW2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC13A1Q9BZW2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC13A1Q9BZW2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC13A1Q9BZW2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC13A1Q9BZW2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC13A1Q9BZW2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC13A1Q9BZW2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC13A1Q9BZW2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC13A1Q9BZW2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC13A1Q9BZW2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC13A1Q9BZW2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC13A1Q9BZW2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC13A1Q9BZW2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC13A1Q9BZW2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC13A1Q9BZW2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC13A1Q9BZW2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC13A1Q9BZW2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC13A1Q9BZW2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC13A1Q9BZW2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC13A1Q9BZW2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC13A1Q9BZW2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC13A1Q9BZW2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC13A1Q9BZW2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC13A1Q9BZW2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC13A1Q9BZW2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC13A1Q9BZW2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC13A1Q9BZW2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC13A1Q9BZW2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC13A1Q9BZW2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC13A1Q9BZW2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC13A1Q9BZW2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC13A1Q9BZW2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC13A1Q9BZW2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC13A1Q9BZW2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC13A1Q9BZW2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC13A1Q9BZW2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC13A1Q9BZW2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC13A1Q9BZW2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC13A1Q9BZW2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC13A1Q9BZW2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC13A1Q9BZW2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC13A1Q9BZW2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC13A1Q9BZW2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC13A1Q9BZW2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC13A1Q9BZW2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC13A1Q9BZW2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms