Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIGD2AQ9BW72 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD2AQ9BW72 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD2AQ9BW72 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD2AQ9BW72 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD2AQ9BW72 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD2AQ9BW72 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD2AQ9BW72 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIGD2AQ9BW72 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIGD2AQ9BW72 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIGD2AQ9BW72 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIGD2AQ9BW72 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HIGD2AQ9BW72 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIGD2AQ9BW72 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIGD2AQ9BW72 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIGD2AQ9BW72 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD2AQ9BW72 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD2AQ9BW72 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD2AQ9BW72 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD2AQ9BW72 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD2AQ9BW72 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD2AQ9BW72 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD2AQ9BW72 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD2AQ9BW72 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD2AQ9BW72 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD2AQ9BW72 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD2AQ9BW72 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD2AQ9BW72 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD2AQ9BW72 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD2AQ9BW72 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HIGD2AQ9BW72 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HIGD2AQ9BW72 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIGD2AQ9BW72 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HIGD2AQ9BW72 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIGD2AQ9BW72 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIGD2AQ9BW72 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIGD2AQ9BW72 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIGD2AQ9BW72 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIGD2AQ9BW72 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIGD2AQ9BW72 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIGD2AQ9BW72 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIGD2AQ9BW72 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIGD2AQ9BW72 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIGD2AQ9BW72 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIGD2AQ9BW72 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIGD2AQ9BW72 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIGD2AQ9BW72 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIGD2AQ9BW72 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIGD2AQ9BW72 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIGD2AQ9BW72 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIGD2AQ9BW72 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIGD2AQ9BW72 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIGD2AQ9BW72 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIGD2AQ9BW72 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIGD2AQ9BW72 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIGD2AQ9BW72 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIGD2AQ9BW72 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIGD2AQ9BW72 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIGD2AQ9BW72 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIGD2AQ9BW72 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIGD2AQ9BW72 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIGD2AQ9BW72 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIGD2AQ9BW72 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIGD2AQ9BW72 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIGD2AQ9BW72 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIGD2AQ9BW72 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HIGD2AQ9BW72 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIGD2AQ9BW72 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD2AQ9BW72 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD2AQ9BW72 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD2AQ9BW72 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD2AQ9BW72 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD2AQ9BW72 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD2AQ9BW72 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD2AQ9BW72 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD2AQ9BW72 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD2AQ9BW72 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD2AQ9BW72 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD2AQ9BW72 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD2AQ9BW72 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD2AQ9BW72 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD2AQ9BW72 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD2AQ9BW72 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD2AQ9BW72 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD2AQ9BW72 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD2AQ9BW72 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIGD2AQ9BW72 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIGD2AQ9BW72 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HIGD2AQ9BW72 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD2AQ9BW72 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HIGD2AQ9BW72 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD2AQ9BW72 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD2AQ9BW72 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD2AQ9BW72 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD2AQ9BW72 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIGD2AQ9BW72 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIGD2AQ9BW72 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIGD2AQ9BW72 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIGD2AQ9BW72 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms