Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUQ8

DDX23, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX23Q9BUQ8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX23Q9BUQ8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX23Q9BUQ8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX23Q9BUQ8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX23Q9BUQ8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX23Q9BUQ8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX23Q9BUQ8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX23Q9BUQ8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX23Q9BUQ8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX23Q9BUQ8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX23Q9BUQ8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX23Q9BUQ8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX23Q9BUQ8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX23Q9BUQ8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX23Q9BUQ8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX23Q9BUQ8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX23Q9BUQ8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX23Q9BUQ8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX23Q9BUQ8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX23Q9BUQ8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX23Q9BUQ8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX23Q9BUQ8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX23Q9BUQ8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX23Q9BUQ8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX23Q9BUQ8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DDX23Q9BUQ8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDX23Q9BUQ8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DDX23Q9BUQ8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DDX23Q9BUQ8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
DDX23Q9BUQ8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX23Q9BUQ8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX23Q9BUQ8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX23Q9BUQ8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX23Q9BUQ8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX23Q9BUQ8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX23Q9BUQ8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX23Q9BUQ8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX23Q9BUQ8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX23Q9BUQ8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX23Q9BUQ8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX23Q9BUQ8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX23Q9BUQ8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX23Q9BUQ8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX23Q9BUQ8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX23Q9BUQ8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX23Q9BUQ8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX23Q9BUQ8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX23Q9BUQ8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX23Q9BUQ8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX23Q9BUQ8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX23Q9BUQ8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX23Q9BUQ8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX23Q9BUQ8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX23Q9BUQ8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX23Q9BUQ8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX23Q9BUQ8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX23Q9BUQ8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX23Q9BUQ8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX23Q9BUQ8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX23Q9BUQ8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX23Q9BUQ8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX23Q9BUQ8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX23Q9BUQ8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX23Q9BUQ8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
DDX23Q9BUQ8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX23Q9BUQ8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX23Q9BUQ8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX23Q9BUQ8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX23Q9BUQ8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX23Q9BUQ8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX23Q9BUQ8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX23Q9BUQ8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX23Q9BUQ8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX23Q9BUQ8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX23Q9BUQ8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX23Q9BUQ8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX23Q9BUQ8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX23Q9BUQ8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX23Q9BUQ8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX23Q9BUQ8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX23Q9BUQ8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX23Q9BUQ8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX23Q9BUQ8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX23Q9BUQ8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX23Q9BUQ8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX23Q9BUQ8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX23Q9BUQ8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX23Q9BUQ8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX23Q9BUQ8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX23Q9BUQ8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX23Q9BUQ8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX23Q9BUQ8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX23Q9BUQ8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX23Q9BUQ8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX23Q9BUQ8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX23Q9BUQ8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX23Q9BUQ8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX23Q9BUQ8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX23Q9BUQ8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX23Q9BUQ8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms