Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF559Q9BR84 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF559Q9BR84 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF559Q9BR84 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF559Q9BR84 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF559Q9BR84 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF559Q9BR84 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF559Q9BR84 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF559Q9BR84 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF559Q9BR84 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF559Q9BR84 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF559Q9BR84 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF559Q9BR84 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF559Q9BR84 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF559Q9BR84 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF559Q9BR84 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF559Q9BR84 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF559Q9BR84 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF559Q9BR84 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF559Q9BR84 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF559Q9BR84 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF559Q9BR84 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF559Q9BR84 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF559Q9BR84 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF559Q9BR84 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF559Q9BR84 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF559Q9BR84 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF559Q9BR84 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF559Q9BR84 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF559Q9BR84 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF559Q9BR84 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF559Q9BR84 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF559Q9BR84 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF559Q9BR84 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF559Q9BR84 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF559Q9BR84 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF559Q9BR84 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF559Q9BR84 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF559Q9BR84 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF559Q9BR84 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF559Q9BR84 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF559Q9BR84 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF559Q9BR84 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF559Q9BR84 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF559Q9BR84 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF559Q9BR84 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF559Q9BR84 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF559Q9BR84 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF559Q9BR84 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF559Q9BR84 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF559Q9BR84 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF559Q9BR84 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF559Q9BR84 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF559Q9BR84 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF559Q9BR84 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF559Q9BR84 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF559Q9BR84 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF559Q9BR84 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF559Q9BR84 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF559Q9BR84 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF559Q9BR84 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF559Q9BR84 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF559Q9BR84 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF559Q9BR84 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF559Q9BR84 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF559Q9BR84 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF559Q9BR84 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF559Q9BR84 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF559Q9BR84 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF559Q9BR84 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF559Q9BR84 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF559Q9BR84 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF559Q9BR84 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF559Q9BR84 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF559Q9BR84 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF559Q9BR84 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF559Q9BR84 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF559Q9BR84 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF559Q9BR84 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF559Q9BR84 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF559Q9BR84 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF559Q9BR84 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF559Q9BR84 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF559Q9BR84 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF559Q9BR84 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF559Q9BR84 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF559Q9BR84 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF559Q9BR84 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF559Q9BR84 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF559Q9BR84 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF559Q9BR84 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF559Q9BR84 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF559Q9BR84 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF559Q9BR84 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF559Q9BR84 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF559Q9BR84 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF559Q9BR84 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF559Q9BR84 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF559Q9BR84 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF559Q9BR84 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms