Protein–RNA interactions for Protein: Q99496

RNF2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF2Q99496 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RNF2Q99496 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RNF2Q99496 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RNF2Q99496 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RNF2Q99496 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNF2Q99496 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNF2Q99496 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNF2Q99496 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RNF2Q99496 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNF2Q99496 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNF2Q99496 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNF2Q99496 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RNF2Q99496 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF2Q99496 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RNF2Q99496 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNF2Q99496 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNF2Q99496 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNF2Q99496 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNF2Q99496 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RNF2Q99496 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNF2Q99496 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNF2Q99496 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RNF2Q99496 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RNF2Q99496 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RNF2Q99496 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RNF2Q99496 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RNF2Q99496 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RNF2Q99496 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RNF2Q99496 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RNF2Q99496 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RNF2Q99496 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RNF2Q99496 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RNF2Q99496 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RNF2Q99496 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNF2Q99496 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNF2Q99496 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNF2Q99496 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RNF2Q99496 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RNF2Q99496 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RNF2Q99496 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RNF2Q99496 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RNF2Q99496 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RNF2Q99496 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RNF2Q99496 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
RNF2Q99496 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RNF2Q99496 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF2Q99496 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF2Q99496 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF2Q99496 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF2Q99496 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF2Q99496 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF2Q99496 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF2Q99496 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF2Q99496 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF2Q99496 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF2Q99496 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF2Q99496 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF2Q99496 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF2Q99496 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF2Q99496 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF2Q99496 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF2Q99496 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF2Q99496 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF2Q99496 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF2Q99496 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF2Q99496 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF2Q99496 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF2Q99496 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF2Q99496 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF2Q99496 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF2Q99496 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF2Q99496 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF2Q99496 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF2Q99496 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF2Q99496 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF2Q99496 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF2Q99496 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF2Q99496 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF2Q99496 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF2Q99496 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF2Q99496 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF2Q99496 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF2Q99496 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF2Q99496 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF2Q99496 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNF2Q99496 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNF2Q99496 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNF2Q99496 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNF2Q99496 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNF2Q99496 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNF2Q99496 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNF2Q99496 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNF2Q99496 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNF2Q99496 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RNF2Q99496 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RNF2Q99496 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RNF2Q99496 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RNF2Q99496 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNF2Q99496 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RNF2Q99496 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms