Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00208Q96KT6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00208Q96KT6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00208Q96KT6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00208Q96KT6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00208Q96KT6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00208Q96KT6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00208Q96KT6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00208Q96KT6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00208Q96KT6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00208Q96KT6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00208Q96KT6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00208Q96KT6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00208Q96KT6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00208Q96KT6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00208Q96KT6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00208Q96KT6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00208Q96KT6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00208Q96KT6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00208Q96KT6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00208Q96KT6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00208Q96KT6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00208Q96KT6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00208Q96KT6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00208Q96KT6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LINC00208Q96KT6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00208Q96KT6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00208Q96KT6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00208Q96KT6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00208Q96KT6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00208Q96KT6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00208Q96KT6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00208Q96KT6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00208Q96KT6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00208Q96KT6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00208Q96KT6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00208Q96KT6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00208Q96KT6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LINC00208Q96KT6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LINC00208Q96KT6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00208Q96KT6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00208Q96KT6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LINC00208Q96KT6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00208Q96KT6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00208Q96KT6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00208Q96KT6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00208Q96KT6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00208Q96KT6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00208Q96KT6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00208Q96KT6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00208Q96KT6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00208Q96KT6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00208Q96KT6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00208Q96KT6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00208Q96KT6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00208Q96KT6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00208Q96KT6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00208Q96KT6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00208Q96KT6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00208Q96KT6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00208Q96KT6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00208Q96KT6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00208Q96KT6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00208Q96KT6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00208Q96KT6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00208Q96KT6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00208Q96KT6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LINC00208Q96KT6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00208Q96KT6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00208Q96KT6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00208Q96KT6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LINC00208Q96KT6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00208Q96KT6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00208Q96KT6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00208Q96KT6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00208Q96KT6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00208Q96KT6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00208Q96KT6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LINC00208Q96KT6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00208Q96KT6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00208Q96KT6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00208Q96KT6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00208Q96KT6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00208Q96KT6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00208Q96KT6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00208Q96KT6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00208Q96KT6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00208Q96KT6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00208Q96KT6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00208Q96KT6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00208Q96KT6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00208Q96KT6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00208Q96KT6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00208Q96KT6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00208Q96KT6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00208Q96KT6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00208Q96KT6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00208Q96KT6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00208Q96KT6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00208Q96KT6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms