Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00526Q96FQ7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00526Q96FQ7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00526Q96FQ7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00526Q96FQ7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00526Q96FQ7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00526Q96FQ7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00526Q96FQ7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00526Q96FQ7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC00526Q96FQ7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00526Q96FQ7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00526Q96FQ7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00526Q96FQ7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00526Q96FQ7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00526Q96FQ7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00526Q96FQ7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00526Q96FQ7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00526Q96FQ7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00526Q96FQ7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00526Q96FQ7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00526Q96FQ7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00526Q96FQ7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00526Q96FQ7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00526Q96FQ7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00526Q96FQ7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00526Q96FQ7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00526Q96FQ7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00526Q96FQ7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00526Q96FQ7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00526Q96FQ7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00526Q96FQ7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00526Q96FQ7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00526Q96FQ7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LINC00526Q96FQ7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00526Q96FQ7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00526Q96FQ7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00526Q96FQ7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00526Q96FQ7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00526Q96FQ7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00526Q96FQ7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00526Q96FQ7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00526Q96FQ7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00526Q96FQ7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00526Q96FQ7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00526Q96FQ7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00526Q96FQ7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00526Q96FQ7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00526Q96FQ7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00526Q96FQ7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00526Q96FQ7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00526Q96FQ7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00526Q96FQ7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00526Q96FQ7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00526Q96FQ7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00526Q96FQ7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00526Q96FQ7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00526Q96FQ7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00526Q96FQ7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00526Q96FQ7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LINC00526Q96FQ7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00526Q96FQ7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00526Q96FQ7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00526Q96FQ7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00526Q96FQ7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00526Q96FQ7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00526Q96FQ7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00526Q96FQ7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00526Q96FQ7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00526Q96FQ7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00526Q96FQ7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00526Q96FQ7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00526Q96FQ7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00526Q96FQ7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00526Q96FQ7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00526Q96FQ7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00526Q96FQ7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00526Q96FQ7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00526Q96FQ7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00526Q96FQ7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00526Q96FQ7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00526Q96FQ7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00526Q96FQ7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00526Q96FQ7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00526Q96FQ7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00526Q96FQ7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00526Q96FQ7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00526Q96FQ7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00526Q96FQ7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00526Q96FQ7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00526Q96FQ7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00526Q96FQ7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00526Q96FQ7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00526Q96FQ7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00526Q96FQ7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00526Q96FQ7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00526Q96FQ7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00526Q96FQ7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00526Q96FQ7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00526Q96FQ7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00526Q96FQ7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms