Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAJA3Q96EY1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAJA3Q96EY1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAJA3Q96EY1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAJA3Q96EY1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DNAJA3Q96EY1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DNAJA3Q96EY1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DNAJA3Q96EY1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNAJA3Q96EY1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNAJA3Q96EY1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNAJA3Q96EY1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DNAJA3Q96EY1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNAJA3Q96EY1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DNAJA3Q96EY1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNAJA3Q96EY1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNAJA3Q96EY1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAJA3Q96EY1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAJA3Q96EY1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAJA3Q96EY1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAJA3Q96EY1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAJA3Q96EY1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAJA3Q96EY1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAJA3Q96EY1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAJA3Q96EY1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAJA3Q96EY1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAJA3Q96EY1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAJA3Q96EY1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAJA3Q96EY1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAJA3Q96EY1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAJA3Q96EY1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAJA3Q96EY1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAJA3Q96EY1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAJA3Q96EY1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAJA3Q96EY1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAJA3Q96EY1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAJA3Q96EY1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJA3Q96EY1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJA3Q96EY1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJA3Q96EY1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJA3Q96EY1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJA3Q96EY1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAJA3Q96EY1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAJA3Q96EY1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAJA3Q96EY1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAJA3Q96EY1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAJA3Q96EY1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAJA3Q96EY1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAJA3Q96EY1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAJA3Q96EY1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAJA3Q96EY1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAJA3Q96EY1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DNAJA3Q96EY1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAJA3Q96EY1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAJA3Q96EY1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAJA3Q96EY1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAJA3Q96EY1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAJA3Q96EY1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAJA3Q96EY1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAJA3Q96EY1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAJA3Q96EY1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAJA3Q96EY1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAJA3Q96EY1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAJA3Q96EY1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAJA3Q96EY1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAJA3Q96EY1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJA3Q96EY1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJA3Q96EY1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJA3Q96EY1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJA3Q96EY1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DNAJA3Q96EY1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DNAJA3Q96EY1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAJA3Q96EY1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAJA3Q96EY1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAJA3Q96EY1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAJA3Q96EY1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAJA3Q96EY1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAJA3Q96EY1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAJA3Q96EY1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJA3Q96EY1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJA3Q96EY1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJA3Q96EY1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAJA3Q96EY1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAJA3Q96EY1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAJA3Q96EY1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAJA3Q96EY1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAJA3Q96EY1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAJA3Q96EY1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAJA3Q96EY1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJA3Q96EY1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJA3Q96EY1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJA3Q96EY1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAJA3Q96EY1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJA3Q96EY1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJA3Q96EY1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJA3Q96EY1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJA3Q96EY1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJA3Q96EY1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJA3Q96EY1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAJA3Q96EY1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAJA3Q96EY1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms