Protein–RNA interactions for Protein: Q96CD0

FBXL8, F-box/LRR-repeat protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL8Q96CD0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXL8Q96CD0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXL8Q96CD0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXL8Q96CD0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXL8Q96CD0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXL8Q96CD0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXL8Q96CD0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXL8Q96CD0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXL8Q96CD0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXL8Q96CD0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXL8Q96CD0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXL8Q96CD0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXL8Q96CD0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXL8Q96CD0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXL8Q96CD0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXL8Q96CD0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXL8Q96CD0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXL8Q96CD0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXL8Q96CD0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXL8Q96CD0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXL8Q96CD0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXL8Q96CD0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXL8Q96CD0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXL8Q96CD0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXL8Q96CD0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXL8Q96CD0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXL8Q96CD0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXL8Q96CD0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXL8Q96CD0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXL8Q96CD0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXL8Q96CD0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXL8Q96CD0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXL8Q96CD0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXL8Q96CD0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXL8Q96CD0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXL8Q96CD0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXL8Q96CD0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FBXL8Q96CD0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXL8Q96CD0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXL8Q96CD0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXL8Q96CD0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXL8Q96CD0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXL8Q96CD0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FBXL8Q96CD0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXL8Q96CD0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXL8Q96CD0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FBXL8Q96CD0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXL8Q96CD0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FBXL8Q96CD0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXL8Q96CD0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXL8Q96CD0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXL8Q96CD0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXL8Q96CD0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXL8Q96CD0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXL8Q96CD0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXL8Q96CD0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXL8Q96CD0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FBXL8Q96CD0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBXL8Q96CD0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FBXL8Q96CD0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FBXL8Q96CD0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FBXL8Q96CD0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXL8Q96CD0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXL8Q96CD0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXL8Q96CD0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXL8Q96CD0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FBXL8Q96CD0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXL8Q96CD0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXL8Q96CD0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXL8Q96CD0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXL8Q96CD0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXL8Q96CD0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FBXL8Q96CD0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXL8Q96CD0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXL8Q96CD0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXL8Q96CD0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXL8Q96CD0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXL8Q96CD0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXL8Q96CD0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXL8Q96CD0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXL8Q96CD0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FBXL8Q96CD0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXL8Q96CD0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXL8Q96CD0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXL8Q96CD0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXL8Q96CD0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXL8Q96CD0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXL8Q96CD0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXL8Q96CD0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXL8Q96CD0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXL8Q96CD0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXL8Q96CD0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXL8Q96CD0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXL8Q96CD0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXL8Q96CD0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXL8Q96CD0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXL8Q96CD0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXL8Q96CD0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXL8Q96CD0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXL8Q96CD0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms