Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWP7

GIMAP1, GTPase IMAP family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMAP1Q8WWP7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIMAP1Q8WWP7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIMAP1Q8WWP7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GIMAP1Q8WWP7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIMAP1Q8WWP7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIMAP1Q8WWP7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIMAP1Q8WWP7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GIMAP1Q8WWP7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GIMAP1Q8WWP7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GIMAP1Q8WWP7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIMAP1Q8WWP7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIMAP1Q8WWP7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIMAP1Q8WWP7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIMAP1Q8WWP7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIMAP1Q8WWP7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIMAP1Q8WWP7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIMAP1Q8WWP7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIMAP1Q8WWP7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIMAP1Q8WWP7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIMAP1Q8WWP7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIMAP1Q8WWP7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIMAP1Q8WWP7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIMAP1Q8WWP7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GIMAP1Q8WWP7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIMAP1Q8WWP7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GIMAP1Q8WWP7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIMAP1Q8WWP7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIMAP1Q8WWP7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GIMAP1Q8WWP7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GIMAP1Q8WWP7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GIMAP1Q8WWP7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GIMAP1Q8WWP7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GIMAP1Q8WWP7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GIMAP1Q8WWP7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GIMAP1Q8WWP7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIMAP1Q8WWP7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIMAP1Q8WWP7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GIMAP1Q8WWP7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GIMAP1Q8WWP7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GIMAP1Q8WWP7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GIMAP1Q8WWP7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GIMAP1Q8WWP7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GIMAP1Q8WWP7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GIMAP1Q8WWP7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GIMAP1Q8WWP7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GIMAP1Q8WWP7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIMAP1Q8WWP7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GIMAP1Q8WWP7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIMAP1Q8WWP7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIMAP1Q8WWP7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIMAP1Q8WWP7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIMAP1Q8WWP7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIMAP1Q8WWP7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIMAP1Q8WWP7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GIMAP1Q8WWP7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIMAP1Q8WWP7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIMAP1Q8WWP7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GIMAP1Q8WWP7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GIMAP1Q8WWP7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GIMAP1Q8WWP7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GIMAP1Q8WWP7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GIMAP1Q8WWP7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GIMAP1Q8WWP7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GIMAP1Q8WWP7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GIMAP1Q8WWP7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GIMAP1Q8WWP7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GIMAP1Q8WWP7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GIMAP1Q8WWP7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GIMAP1Q8WWP7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GIMAP1Q8WWP7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIMAP1Q8WWP7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIMAP1Q8WWP7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GIMAP1Q8WWP7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIMAP1Q8WWP7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIMAP1Q8WWP7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GIMAP1Q8WWP7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GIMAP1Q8WWP7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GIMAP1Q8WWP7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GIMAP1Q8WWP7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GIMAP1Q8WWP7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GIMAP1Q8WWP7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GIMAP1Q8WWP7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GIMAP1Q8WWP7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIMAP1Q8WWP7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIMAP1Q8WWP7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIMAP1Q8WWP7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIMAP1Q8WWP7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GIMAP1Q8WWP7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GIMAP1Q8WWP7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GIMAP1Q8WWP7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GIMAP1Q8WWP7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIMAP1Q8WWP7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIMAP1Q8WWP7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIMAP1Q8WWP7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GIMAP1Q8WWP7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIMAP1Q8WWP7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIMAP1Q8WWP7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GIMAP1Q8WWP7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GIMAP1Q8WWP7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GIMAP1Q8WWP7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.1 ms