Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC4Q8WW27 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC4Q8WW27 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC4Q8WW27 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC4Q8WW27 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBEC4Q8WW27 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBEC4Q8WW27 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBEC4Q8WW27 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBEC4Q8WW27 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC4Q8WW27 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC4Q8WW27 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC4Q8WW27 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC4Q8WW27 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBEC4Q8WW27 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBEC4Q8WW27 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBEC4Q8WW27 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBEC4Q8WW27 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOBEC4Q8WW27 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
APOBEC4Q8WW27 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOBEC4Q8WW27 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOBEC4Q8WW27 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
APOBEC4Q8WW27 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOBEC4Q8WW27 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC4Q8WW27 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC4Q8WW27 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC4Q8WW27 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC4Q8WW27 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOBEC4Q8WW27 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOBEC4Q8WW27 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC4Q8WW27 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC4Q8WW27 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC4Q8WW27 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOBEC4Q8WW27 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC4Q8WW27 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC4Q8WW27 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC4Q8WW27 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC4Q8WW27 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC4Q8WW27 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC4Q8WW27 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC4Q8WW27 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC4Q8WW27 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC4Q8WW27 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC4Q8WW27 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC4Q8WW27 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC4Q8WW27 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC4Q8WW27 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC4Q8WW27 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC4Q8WW27 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC4Q8WW27 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC4Q8WW27 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC4Q8WW27 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC4Q8WW27 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC4Q8WW27 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC4Q8WW27 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC4Q8WW27 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC4Q8WW27 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC4Q8WW27 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC4Q8WW27 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC4Q8WW27 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBEC4Q8WW27 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBEC4Q8WW27 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBEC4Q8WW27 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBEC4Q8WW27 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBEC4Q8WW27 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBEC4Q8WW27 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC4Q8WW27 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC4Q8WW27 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
APOBEC4Q8WW27 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBEC4Q8WW27 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBEC4Q8WW27 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBEC4Q8WW27 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOBEC4Q8WW27 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC4Q8WW27 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC4Q8WW27 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC4Q8WW27 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC4Q8WW27 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC4Q8WW27 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOBEC4Q8WW27 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC4Q8WW27 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC4Q8WW27 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC4Q8WW27 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOBEC4Q8WW27 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC4Q8WW27 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC4Q8WW27 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOBEC4Q8WW27 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC4Q8WW27 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC4Q8WW27 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC4Q8WW27 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC4Q8WW27 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC4Q8WW27 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC4Q8WW27 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC4Q8WW27 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC4Q8WW27 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOBEC4Q8WW27 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC4Q8WW27 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC4Q8WW27 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOBEC4Q8WW27 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
APOBEC4Q8WW27 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOBEC4Q8WW27 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOBEC4Q8WW27 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms