Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDAC7Q8WUI4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDAC7Q8WUI4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HDAC7Q8WUI4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDAC7Q8WUI4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HDAC7Q8WUI4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HDAC7Q8WUI4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HDAC7Q8WUI4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HDAC7Q8WUI4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HDAC7Q8WUI4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HDAC7Q8WUI4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDAC7Q8WUI4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDAC7Q8WUI4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDAC7Q8WUI4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDAC7Q8WUI4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDAC7Q8WUI4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDAC7Q8WUI4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HDAC7Q8WUI4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HDAC7Q8WUI4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
HDAC7Q8WUI4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HDAC7Q8WUI4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HDAC7Q8WUI4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HDAC7Q8WUI4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HDAC7Q8WUI4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HDAC7Q8WUI4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HDAC7Q8WUI4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HDAC7Q8WUI4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HDAC7Q8WUI4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HDAC7Q8WUI4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HDAC7Q8WUI4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HDAC7Q8WUI4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HDAC7Q8WUI4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HDAC7Q8WUI4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
HDAC7Q8WUI4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HDAC7Q8WUI4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HDAC7Q8WUI4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HDAC7Q8WUI4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HDAC7Q8WUI4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HDAC7Q8WUI4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HDAC7Q8WUI4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HDAC7Q8WUI4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HDAC7Q8WUI4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HDAC7Q8WUI4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HDAC7Q8WUI4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HDAC7Q8WUI4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HDAC7Q8WUI4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HDAC7Q8WUI4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDAC7Q8WUI4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDAC7Q8WUI4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
HDAC7Q8WUI4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HDAC7Q8WUI4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
HDAC7Q8WUI4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
HDAC7Q8WUI4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HDAC7Q8WUI4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HDAC7Q8WUI4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HDAC7Q8WUI4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HDAC7Q8WUI4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HDAC7Q8WUI4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HDAC7Q8WUI4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HDAC7Q8WUI4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HDAC7Q8WUI4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HDAC7Q8WUI4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HDAC7Q8WUI4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HDAC7Q8WUI4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HDAC7Q8WUI4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDAC7Q8WUI4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDAC7Q8WUI4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDAC7Q8WUI4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDAC7Q8WUI4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HDAC7Q8WUI4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HDAC7Q8WUI4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HDAC7Q8WUI4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HDAC7Q8WUI4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HDAC7Q8WUI4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDAC7Q8WUI4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDAC7Q8WUI4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDAC7Q8WUI4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDAC7Q8WUI4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDAC7Q8WUI4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDAC7Q8WUI4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HDAC7Q8WUI4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDAC7Q8WUI4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDAC7Q8WUI4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDAC7Q8WUI4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDAC7Q8WUI4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDAC7Q8WUI4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDAC7Q8WUI4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDAC7Q8WUI4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDAC7Q8WUI4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDAC7Q8WUI4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
HDAC7Q8WUI4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDAC7Q8WUI4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDAC7Q8WUI4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDAC7Q8WUI4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDAC7Q8WUI4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDAC7Q8WUI4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDAC7Q8WUI4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDAC7Q8WUI4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDAC7Q8WUI4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDAC7Q8WUI4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms