Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RAB11FIP4Q86YS3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RAB11FIP4Q86YS3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RAB11FIP4Q86YS3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RAB11FIP4Q86YS3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RAB11FIP4Q86YS3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RAB11FIP4Q86YS3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RAB11FIP4Q86YS3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RAB11FIP4Q86YS3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RAB11FIP4Q86YS3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RAB11FIP4Q86YS3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RAB11FIP4Q86YS3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RAB11FIP4Q86YS3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RAB11FIP4Q86YS3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RAB11FIP4Q86YS3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RAB11FIP4Q86YS3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RAB11FIP4Q86YS3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RAB11FIP4Q86YS3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RAB11FIP4Q86YS3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
RAB11FIP4Q86YS3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RAB11FIP4Q86YS3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RAB11FIP4Q86YS3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RAB11FIP4Q86YS3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RAB11FIP4Q86YS3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RAB11FIP4Q86YS3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
RAB11FIP4Q86YS3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RAB11FIP4Q86YS3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RAB11FIP4Q86YS3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
RAB11FIP4Q86YS3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RAB11FIP4Q86YS3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RAB11FIP4Q86YS3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RAB11FIP4Q86YS3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RAB11FIP4Q86YS3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RAB11FIP4Q86YS3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RAB11FIP4Q86YS3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RAB11FIP4Q86YS3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
RAB11FIP4Q86YS3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RAB11FIP4Q86YS3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RAB11FIP4Q86YS3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RAB11FIP4Q86YS3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RAB11FIP4Q86YS3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RAB11FIP4Q86YS3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RAB11FIP4Q86YS3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RAB11FIP4Q86YS3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RAB11FIP4Q86YS3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RAB11FIP4Q86YS3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RAB11FIP4Q86YS3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RAB11FIP4Q86YS3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RAB11FIP4Q86YS3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RAB11FIP4Q86YS3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RAB11FIP4Q86YS3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RAB11FIP4Q86YS3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
RAB11FIP4Q86YS3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
RAB11FIP4Q86YS3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
RAB11FIP4Q86YS3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RAB11FIP4Q86YS3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RAB11FIP4Q86YS3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RAB11FIP4Q86YS3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RAB11FIP4Q86YS3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RAB11FIP4Q86YS3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RAB11FIP4Q86YS3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RAB11FIP4Q86YS3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RAB11FIP4Q86YS3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
RAB11FIP4Q86YS3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RAB11FIP4Q86YS3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RAB11FIP4Q86YS3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RAB11FIP4Q86YS3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
RAB11FIP4Q86YS3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RAB11FIP4Q86YS3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RAB11FIP4Q86YS3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RAB11FIP4Q86YS3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RAB11FIP4Q86YS3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RAB11FIP4Q86YS3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RAB11FIP4Q86YS3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RAB11FIP4Q86YS3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RAB11FIP4Q86YS3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RAB11FIP4Q86YS3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RAB11FIP4Q86YS3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RAB11FIP4Q86YS3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RAB11FIP4Q86YS3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RAB11FIP4Q86YS3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RAB11FIP4Q86YS3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RAB11FIP4Q86YS3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RAB11FIP4Q86YS3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RAB11FIP4Q86YS3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RAB11FIP4Q86YS3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RAB11FIP4Q86YS3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RAB11FIP4Q86YS3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RAB11FIP4Q86YS3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
RAB11FIP4Q86YS3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RAB11FIP4Q86YS3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RAB11FIP4Q86YS3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RAB11FIP4Q86YS3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RAB11FIP4Q86YS3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RAB11FIP4Q86YS3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RAB11FIP4Q86YS3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms