Protein–RNA interactions for Protein: Q86X19

TMEM17, Transmembrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM17Q86X19 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM17Q86X19 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM17Q86X19 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM17Q86X19 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM17Q86X19 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM17Q86X19 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM17Q86X19 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM17Q86X19 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM17Q86X19 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM17Q86X19 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM17Q86X19 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM17Q86X19 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM17Q86X19 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM17Q86X19 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM17Q86X19 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM17Q86X19 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM17Q86X19 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM17Q86X19 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM17Q86X19 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM17Q86X19 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM17Q86X19 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM17Q86X19 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM17Q86X19 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM17Q86X19 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM17Q86X19 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM17Q86X19 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM17Q86X19 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM17Q86X19 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM17Q86X19 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM17Q86X19 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM17Q86X19 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM17Q86X19 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM17Q86X19 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM17Q86X19 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM17Q86X19 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM17Q86X19 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM17Q86X19 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM17Q86X19 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM17Q86X19 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM17Q86X19 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM17Q86X19 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM17Q86X19 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM17Q86X19 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM17Q86X19 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM17Q86X19 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM17Q86X19 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM17Q86X19 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM17Q86X19 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM17Q86X19 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM17Q86X19 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM17Q86X19 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM17Q86X19 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM17Q86X19 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM17Q86X19 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM17Q86X19 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM17Q86X19 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM17Q86X19 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM17Q86X19 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM17Q86X19 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM17Q86X19 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM17Q86X19 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM17Q86X19 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM17Q86X19 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM17Q86X19 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM17Q86X19 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM17Q86X19 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM17Q86X19 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM17Q86X19 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM17Q86X19 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM17Q86X19 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM17Q86X19 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM17Q86X19 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM17Q86X19 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM17Q86X19 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMEM17Q86X19 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM17Q86X19 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM17Q86X19 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM17Q86X19 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM17Q86X19 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM17Q86X19 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM17Q86X19 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM17Q86X19 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM17Q86X19 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM17Q86X19 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM17Q86X19 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMEM17Q86X19 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM17Q86X19 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM17Q86X19 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM17Q86X19 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM17Q86X19 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM17Q86X19 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM17Q86X19 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM17Q86X19 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM17Q86X19 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM17Q86X19 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM17Q86X19 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM17Q86X19 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM17Q86X19 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM17Q86X19 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM17Q86X19 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms