Protein–RNA interactions for Protein: Q6XE38

SCGB1D4, Secretoglobin family 1D member 4, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB1D4Q6XE38 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCGB1D4Q6XE38 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCGB1D4Q6XE38 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCGB1D4Q6XE38 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCGB1D4Q6XE38 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCGB1D4Q6XE38 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCGB1D4Q6XE38 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCGB1D4Q6XE38 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCGB1D4Q6XE38 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCGB1D4Q6XE38 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCGB1D4Q6XE38 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCGB1D4Q6XE38 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCGB1D4Q6XE38 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCGB1D4Q6XE38 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCGB1D4Q6XE38 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SCGB1D4Q6XE38 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCGB1D4Q6XE38 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCGB1D4Q6XE38 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCGB1D4Q6XE38 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCGB1D4Q6XE38 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCGB1D4Q6XE38 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCGB1D4Q6XE38 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCGB1D4Q6XE38 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCGB1D4Q6XE38 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCGB1D4Q6XE38 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCGB1D4Q6XE38 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCGB1D4Q6XE38 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCGB1D4Q6XE38 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCGB1D4Q6XE38 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCGB1D4Q6XE38 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCGB1D4Q6XE38 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCGB1D4Q6XE38 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCGB1D4Q6XE38 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCGB1D4Q6XE38 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCGB1D4Q6XE38 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCGB1D4Q6XE38 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCGB1D4Q6XE38 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCGB1D4Q6XE38 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCGB1D4Q6XE38 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCGB1D4Q6XE38 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCGB1D4Q6XE38 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCGB1D4Q6XE38 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCGB1D4Q6XE38 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCGB1D4Q6XE38 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SCGB1D4Q6XE38 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCGB1D4Q6XE38 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCGB1D4Q6XE38 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCGB1D4Q6XE38 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCGB1D4Q6XE38 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCGB1D4Q6XE38 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCGB1D4Q6XE38 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCGB1D4Q6XE38 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCGB1D4Q6XE38 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCGB1D4Q6XE38 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCGB1D4Q6XE38 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCGB1D4Q6XE38 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCGB1D4Q6XE38 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCGB1D4Q6XE38 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCGB1D4Q6XE38 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCGB1D4Q6XE38 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCGB1D4Q6XE38 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCGB1D4Q6XE38 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCGB1D4Q6XE38 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCGB1D4Q6XE38 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCGB1D4Q6XE38 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCGB1D4Q6XE38 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCGB1D4Q6XE38 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCGB1D4Q6XE38 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCGB1D4Q6XE38 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCGB1D4Q6XE38 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCGB1D4Q6XE38 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCGB1D4Q6XE38 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCGB1D4Q6XE38 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCGB1D4Q6XE38 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCGB1D4Q6XE38 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCGB1D4Q6XE38 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCGB1D4Q6XE38 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCGB1D4Q6XE38 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCGB1D4Q6XE38 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCGB1D4Q6XE38 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCGB1D4Q6XE38 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCGB1D4Q6XE38 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCGB1D4Q6XE38 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCGB1D4Q6XE38 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCGB1D4Q6XE38 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCGB1D4Q6XE38 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCGB1D4Q6XE38 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCGB1D4Q6XE38 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCGB1D4Q6XE38 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCGB1D4Q6XE38 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCGB1D4Q6XE38 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCGB1D4Q6XE38 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCGB1D4Q6XE38 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCGB1D4Q6XE38 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCGB1D4Q6XE38 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCGB1D4Q6XE38 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCGB1D4Q6XE38 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCGB1D4Q6XE38 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCGB1D4Q6XE38 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCGB1D4Q6XE38 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms