Protein–RNA interactions for Protein: Q6VMQ6

ATF7IP, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7IPQ6VMQ6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ATF7IPQ6VMQ6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ATF7IPQ6VMQ6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ATF7IPQ6VMQ6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ATF7IPQ6VMQ6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ATF7IPQ6VMQ6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ATF7IPQ6VMQ6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ATF7IPQ6VMQ6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ATF7IPQ6VMQ6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
ATF7IPQ6VMQ6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ATF7IPQ6VMQ6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ATF7IPQ6VMQ6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ATF7IPQ6VMQ6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ATF7IPQ6VMQ6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ATF7IPQ6VMQ6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ATF7IPQ6VMQ6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ATF7IPQ6VMQ6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ATF7IPQ6VMQ6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ATF7IPQ6VMQ6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ATF7IPQ6VMQ6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ATF7IPQ6VMQ6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
ATF7IPQ6VMQ6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.96
ATF7IPQ6VMQ6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ATF7IPQ6VMQ6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ATF7IPQ6VMQ6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ATF7IPQ6VMQ6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ATF7IPQ6VMQ6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ATF7IPQ6VMQ6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ATF7IPQ6VMQ6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ATF7IPQ6VMQ6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ATF7IPQ6VMQ6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ATF7IPQ6VMQ6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ATF7IPQ6VMQ6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
ATF7IPQ6VMQ6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ATF7IPQ6VMQ6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
ATF7IPQ6VMQ6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ATF7IPQ6VMQ6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ATF7IPQ6VMQ6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ATF7IPQ6VMQ6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ATF7IPQ6VMQ6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ATF7IPQ6VMQ6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ATF7IPQ6VMQ6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ATF7IPQ6VMQ6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ATF7IPQ6VMQ6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ATF7IPQ6VMQ6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ATF7IPQ6VMQ6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ATF7IPQ6VMQ6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ATF7IPQ6VMQ6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ATF7IPQ6VMQ6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ATF7IPQ6VMQ6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ATF7IPQ6VMQ6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ATF7IPQ6VMQ6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ATF7IPQ6VMQ6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ATF7IPQ6VMQ6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ATF7IPQ6VMQ6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ATF7IPQ6VMQ6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ATF7IPQ6VMQ6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ATF7IPQ6VMQ6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ATF7IPQ6VMQ6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ATF7IPQ6VMQ6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
ATF7IPQ6VMQ6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ATF7IPQ6VMQ6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ATF7IPQ6VMQ6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATF7IPQ6VMQ6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATF7IPQ6VMQ6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATF7IPQ6VMQ6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
ATF7IPQ6VMQ6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATF7IPQ6VMQ6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ATF7IPQ6VMQ6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ATF7IPQ6VMQ6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ATF7IPQ6VMQ6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ATF7IPQ6VMQ6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ATF7IPQ6VMQ6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ATF7IPQ6VMQ6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ATF7IPQ6VMQ6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ATF7IPQ6VMQ6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ATF7IPQ6VMQ6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ATF7IPQ6VMQ6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ATF7IPQ6VMQ6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ATF7IPQ6VMQ6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ATF7IPQ6VMQ6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ATF7IPQ6VMQ6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ATF7IPQ6VMQ6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
ATF7IPQ6VMQ6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ATF7IPQ6VMQ6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
ATF7IPQ6VMQ6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ATF7IPQ6VMQ6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ATF7IPQ6VMQ6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ATF7IPQ6VMQ6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ATF7IPQ6VMQ6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ATF7IPQ6VMQ6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ATF7IPQ6VMQ6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ATF7IPQ6VMQ6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ATF7IPQ6VMQ6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ATF7IPQ6VMQ6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATF7IPQ6VMQ6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATF7IPQ6VMQ6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ATF7IPQ6VMQ6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ATF7IPQ6VMQ6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
ATF7IPQ6VMQ6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms