Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CCDC171Q6TFL3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CCDC171Q6TFL3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CCDC171Q6TFL3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CCDC171Q6TFL3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CCDC171Q6TFL3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CCDC171Q6TFL3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CCDC171Q6TFL3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CCDC171Q6TFL3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CCDC171Q6TFL3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CCDC171Q6TFL3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CCDC171Q6TFL3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CCDC171Q6TFL3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CCDC171Q6TFL3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
CCDC171Q6TFL3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC171Q6TFL3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC171Q6TFL3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC171Q6TFL3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC171Q6TFL3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CCDC171Q6TFL3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CCDC171Q6TFL3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
CCDC171Q6TFL3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
CCDC171Q6TFL3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CCDC171Q6TFL3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
CCDC171Q6TFL3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC171Q6TFL3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC171Q6TFL3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC171Q6TFL3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC171Q6TFL3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC171Q6TFL3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC171Q6TFL3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC171Q6TFL3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC171Q6TFL3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC171Q6TFL3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC171Q6TFL3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC171Q6TFL3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC171Q6TFL3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC171Q6TFL3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC171Q6TFL3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC171Q6TFL3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC171Q6TFL3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC171Q6TFL3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC171Q6TFL3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC171Q6TFL3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC171Q6TFL3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC171Q6TFL3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC171Q6TFL3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC171Q6TFL3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC171Q6TFL3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC171Q6TFL3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC171Q6TFL3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC171Q6TFL3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC171Q6TFL3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC171Q6TFL3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC171Q6TFL3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC171Q6TFL3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC171Q6TFL3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC171Q6TFL3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC171Q6TFL3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC171Q6TFL3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC171Q6TFL3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC171Q6TFL3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CCDC171Q6TFL3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC171Q6TFL3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC171Q6TFL3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC171Q6TFL3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC171Q6TFL3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC171Q6TFL3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC171Q6TFL3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC171Q6TFL3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC171Q6TFL3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC171Q6TFL3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC171Q6TFL3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC171Q6TFL3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC171Q6TFL3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC171Q6TFL3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC171Q6TFL3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC171Q6TFL3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC171Q6TFL3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CCDC171Q6TFL3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CCDC171Q6TFL3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC171Q6TFL3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC171Q6TFL3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC171Q6TFL3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC171Q6TFL3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC171Q6TFL3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC171Q6TFL3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC171Q6TFL3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC171Q6TFL3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC171Q6TFL3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC171Q6TFL3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC171Q6TFL3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC171Q6TFL3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC171Q6TFL3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC171Q6TFL3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC171Q6TFL3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC171Q6TFL3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC171Q6TFL3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC171Q6TFL3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CCDC171Q6TFL3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms