Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RHBDF2Q6PJF5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RHBDF2Q6PJF5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RHBDF2Q6PJF5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RHBDF2Q6PJF5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RHBDF2Q6PJF5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RHBDF2Q6PJF5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RHBDF2Q6PJF5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RHBDF2Q6PJF5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RHBDF2Q6PJF5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RHBDF2Q6PJF5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RHBDF2Q6PJF5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RHBDF2Q6PJF5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RHBDF2Q6PJF5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RHBDF2Q6PJF5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RHBDF2Q6PJF5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RHBDF2Q6PJF5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RHBDF2Q6PJF5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RHBDF2Q6PJF5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RHBDF2Q6PJF5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RHBDF2Q6PJF5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RHBDF2Q6PJF5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RHBDF2Q6PJF5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RHBDF2Q6PJF5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RHBDF2Q6PJF5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RHBDF2Q6PJF5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RHBDF2Q6PJF5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RHBDF2Q6PJF5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RHBDF2Q6PJF5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RHBDF2Q6PJF5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RHBDF2Q6PJF5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RHBDF2Q6PJF5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RHBDF2Q6PJF5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RHBDF2Q6PJF5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RHBDF2Q6PJF5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RHBDF2Q6PJF5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RHBDF2Q6PJF5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RHBDF2Q6PJF5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RHBDF2Q6PJF5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RHBDF2Q6PJF5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RHBDF2Q6PJF5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RHBDF2Q6PJF5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RHBDF2Q6PJF5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RHBDF2Q6PJF5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RHBDF2Q6PJF5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RHBDF2Q6PJF5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RHBDF2Q6PJF5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RHBDF2Q6PJF5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RHBDF2Q6PJF5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RHBDF2Q6PJF5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RHBDF2Q6PJF5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RHBDF2Q6PJF5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RHBDF2Q6PJF5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RHBDF2Q6PJF5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RHBDF2Q6PJF5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RHBDF2Q6PJF5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RHBDF2Q6PJF5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RHBDF2Q6PJF5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RHBDF2Q6PJF5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RHBDF2Q6PJF5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RHBDF2Q6PJF5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RHBDF2Q6PJF5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RHBDF2Q6PJF5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RHBDF2Q6PJF5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RHBDF2Q6PJF5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RHBDF2Q6PJF5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RHBDF2Q6PJF5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RHBDF2Q6PJF5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RHBDF2Q6PJF5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RHBDF2Q6PJF5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RHBDF2Q6PJF5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RHBDF2Q6PJF5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RHBDF2Q6PJF5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RHBDF2Q6PJF5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RHBDF2Q6PJF5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RHBDF2Q6PJF5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RHBDF2Q6PJF5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RHBDF2Q6PJF5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RHBDF2Q6PJF5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RHBDF2Q6PJF5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RHBDF2Q6PJF5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RHBDF2Q6PJF5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RHBDF2Q6PJF5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RHBDF2Q6PJF5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RHBDF2Q6PJF5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RHBDF2Q6PJF5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RHBDF2Q6PJF5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RHBDF2Q6PJF5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RHBDF2Q6PJF5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RHBDF2Q6PJF5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RHBDF2Q6PJF5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RHBDF2Q6PJF5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RHBDF2Q6PJF5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RHBDF2Q6PJF5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RHBDF2Q6PJF5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RHBDF2Q6PJF5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RHBDF2Q6PJF5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RHBDF2Q6PJF5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RHBDF2Q6PJF5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RHBDF2Q6PJF5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms