Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV3

PTRHD1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTRHD1Q6GMV3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTRHD1Q6GMV3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTRHD1Q6GMV3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTRHD1Q6GMV3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTRHD1Q6GMV3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTRHD1Q6GMV3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTRHD1Q6GMV3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTRHD1Q6GMV3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTRHD1Q6GMV3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTRHD1Q6GMV3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PTRHD1Q6GMV3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTRHD1Q6GMV3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTRHD1Q6GMV3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTRHD1Q6GMV3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTRHD1Q6GMV3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTRHD1Q6GMV3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTRHD1Q6GMV3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTRHD1Q6GMV3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTRHD1Q6GMV3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTRHD1Q6GMV3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTRHD1Q6GMV3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTRHD1Q6GMV3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTRHD1Q6GMV3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTRHD1Q6GMV3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTRHD1Q6GMV3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTRHD1Q6GMV3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTRHD1Q6GMV3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTRHD1Q6GMV3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PTRHD1Q6GMV3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTRHD1Q6GMV3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTRHD1Q6GMV3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTRHD1Q6GMV3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTRHD1Q6GMV3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTRHD1Q6GMV3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTRHD1Q6GMV3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTRHD1Q6GMV3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTRHD1Q6GMV3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTRHD1Q6GMV3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTRHD1Q6GMV3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTRHD1Q6GMV3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTRHD1Q6GMV3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTRHD1Q6GMV3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTRHD1Q6GMV3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTRHD1Q6GMV3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTRHD1Q6GMV3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTRHD1Q6GMV3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTRHD1Q6GMV3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTRHD1Q6GMV3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PTRHD1Q6GMV3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PTRHD1Q6GMV3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTRHD1Q6GMV3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTRHD1Q6GMV3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTRHD1Q6GMV3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTRHD1Q6GMV3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTRHD1Q6GMV3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTRHD1Q6GMV3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTRHD1Q6GMV3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTRHD1Q6GMV3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTRHD1Q6GMV3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTRHD1Q6GMV3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTRHD1Q6GMV3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTRHD1Q6GMV3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTRHD1Q6GMV3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTRHD1Q6GMV3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTRHD1Q6GMV3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTRHD1Q6GMV3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTRHD1Q6GMV3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTRHD1Q6GMV3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTRHD1Q6GMV3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTRHD1Q6GMV3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTRHD1Q6GMV3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTRHD1Q6GMV3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTRHD1Q6GMV3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTRHD1Q6GMV3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTRHD1Q6GMV3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PTRHD1Q6GMV3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTRHD1Q6GMV3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTRHD1Q6GMV3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTRHD1Q6GMV3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTRHD1Q6GMV3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTRHD1Q6GMV3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTRHD1Q6GMV3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTRHD1Q6GMV3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTRHD1Q6GMV3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTRHD1Q6GMV3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTRHD1Q6GMV3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTRHD1Q6GMV3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTRHD1Q6GMV3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PTRHD1Q6GMV3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTRHD1Q6GMV3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTRHD1Q6GMV3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTRHD1Q6GMV3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTRHD1Q6GMV3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTRHD1Q6GMV3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTRHD1Q6GMV3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTRHD1Q6GMV3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTRHD1Q6GMV3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTRHD1Q6GMV3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTRHD1Q6GMV3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTRHD1Q6GMV3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms