Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
MCTP1Q6DN14 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
MCTP1Q6DN14 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
MCTP1Q6DN14 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
MCTP1Q6DN14 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
MCTP1Q6DN14 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
MCTP1Q6DN14 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
MCTP1Q6DN14 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
MCTP1Q6DN14 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
MCTP1Q6DN14 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
MCTP1Q6DN14 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
MCTP1Q6DN14 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
MCTP1Q6DN14 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
MCTP1Q6DN14 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
MCTP1Q6DN14 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
MCTP1Q6DN14 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
MCTP1Q6DN14 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
MCTP1Q6DN14 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
MCTP1Q6DN14 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
MCTP1Q6DN14 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
MCTP1Q6DN14 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
MCTP1Q6DN14 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
MCTP1Q6DN14 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
MCTP1Q6DN14 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
MCTP1Q6DN14 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
MCTP1Q6DN14 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
MCTP1Q6DN14 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
MCTP1Q6DN14 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
MCTP1Q6DN14 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
MCTP1Q6DN14 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
MCTP1Q6DN14 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
MCTP1Q6DN14 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
MCTP1Q6DN14 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
MCTP1Q6DN14 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
MCTP1Q6DN14 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
MCTP1Q6DN14 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
MCTP1Q6DN14 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
MCTP1Q6DN14 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
MCTP1Q6DN14 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
MCTP1Q6DN14 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
MCTP1Q6DN14 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
MCTP1Q6DN14 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
MCTP1Q6DN14 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
MCTP1Q6DN14 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
MCTP1Q6DN14 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
MCTP1Q6DN14 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
MCTP1Q6DN14 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
MCTP1Q6DN14 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
MCTP1Q6DN14 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
MCTP1Q6DN14 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
MCTP1Q6DN14 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
MCTP1Q6DN14 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
MCTP1Q6DN14 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
MCTP1Q6DN14 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
MCTP1Q6DN14 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
MCTP1Q6DN14 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
MCTP1Q6DN14 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
MCTP1Q6DN14 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
MCTP1Q6DN14 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
MCTP1Q6DN14 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
MCTP1Q6DN14 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
MCTP1Q6DN14 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
MCTP1Q6DN14 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MCTP1Q6DN14 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
MCTP1Q6DN14 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
MCTP1Q6DN14 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
MCTP1Q6DN14 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
MCTP1Q6DN14 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
MCTP1Q6DN14 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
MCTP1Q6DN14 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
MCTP1Q6DN14 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MCTP1Q6DN14 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MCTP1Q6DN14 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
MCTP1Q6DN14 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
MCTP1Q6DN14 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
MCTP1Q6DN14 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MCTP1Q6DN14 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MCTP1Q6DN14 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MCTP1Q6DN14 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
MCTP1Q6DN14 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
MCTP1Q6DN14 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
MCTP1Q6DN14 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
MCTP1Q6DN14 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
MCTP1Q6DN14 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MCTP1Q6DN14 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MCTP1Q6DN14 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
MCTP1Q6DN14 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
MCTP1Q6DN14 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MCTP1Q6DN14 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
MCTP1Q6DN14 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
MCTP1Q6DN14 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
MCTP1Q6DN14 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
MCTP1Q6DN14 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
MCTP1Q6DN14 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
MCTP1Q6DN14 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
MCTP1Q6DN14 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
MCTP1Q6DN14 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MCTP1Q6DN14 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MCTP1Q6DN14 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
MCTP1Q6DN14 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms