Protein–RNA interactions for Protein: Q5ZPR3

CD276, CD276 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD276Q5ZPR3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD276Q5ZPR3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD276Q5ZPR3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD276Q5ZPR3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD276Q5ZPR3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD276Q5ZPR3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD276Q5ZPR3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD276Q5ZPR3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD276Q5ZPR3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD276Q5ZPR3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD276Q5ZPR3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD276Q5ZPR3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD276Q5ZPR3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD276Q5ZPR3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD276Q5ZPR3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD276Q5ZPR3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD276Q5ZPR3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD276Q5ZPR3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD276Q5ZPR3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CD276Q5ZPR3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD276Q5ZPR3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD276Q5ZPR3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD276Q5ZPR3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD276Q5ZPR3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD276Q5ZPR3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD276Q5ZPR3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD276Q5ZPR3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD276Q5ZPR3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD276Q5ZPR3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD276Q5ZPR3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD276Q5ZPR3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD276Q5ZPR3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD276Q5ZPR3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD276Q5ZPR3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD276Q5ZPR3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD276Q5ZPR3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD276Q5ZPR3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CD276Q5ZPR3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CD276Q5ZPR3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CD276Q5ZPR3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD276Q5ZPR3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD276Q5ZPR3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD276Q5ZPR3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CD276Q5ZPR3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD276Q5ZPR3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD276Q5ZPR3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD276Q5ZPR3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD276Q5ZPR3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD276Q5ZPR3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD276Q5ZPR3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD276Q5ZPR3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD276Q5ZPR3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD276Q5ZPR3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD276Q5ZPR3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD276Q5ZPR3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD276Q5ZPR3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD276Q5ZPR3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CD276Q5ZPR3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CD276Q5ZPR3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD276Q5ZPR3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD276Q5ZPR3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD276Q5ZPR3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD276Q5ZPR3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD276Q5ZPR3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD276Q5ZPR3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD276Q5ZPR3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD276Q5ZPR3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD276Q5ZPR3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD276Q5ZPR3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD276Q5ZPR3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CD276Q5ZPR3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD276Q5ZPR3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD276Q5ZPR3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD276Q5ZPR3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD276Q5ZPR3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD276Q5ZPR3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD276Q5ZPR3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD276Q5ZPR3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD276Q5ZPR3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD276Q5ZPR3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD276Q5ZPR3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD276Q5ZPR3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD276Q5ZPR3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD276Q5ZPR3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD276Q5ZPR3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD276Q5ZPR3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD276Q5ZPR3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD276Q5ZPR3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD276Q5ZPR3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD276Q5ZPR3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CD276Q5ZPR3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD276Q5ZPR3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD276Q5ZPR3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD276Q5ZPR3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD276Q5ZPR3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD276Q5ZPR3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD276Q5ZPR3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD276Q5ZPR3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD276Q5ZPR3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD276Q5ZPR3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140 ms