Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATAD3CQ5T2N8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATAD3CQ5T2N8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATAD3CQ5T2N8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATAD3CQ5T2N8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATAD3CQ5T2N8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATAD3CQ5T2N8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATAD3CQ5T2N8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATAD3CQ5T2N8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATAD3CQ5T2N8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATAD3CQ5T2N8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATAD3CQ5T2N8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATAD3CQ5T2N8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATAD3CQ5T2N8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATAD3CQ5T2N8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATAD3CQ5T2N8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATAD3CQ5T2N8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATAD3CQ5T2N8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATAD3CQ5T2N8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATAD3CQ5T2N8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATAD3CQ5T2N8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATAD3CQ5T2N8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATAD3CQ5T2N8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATAD3CQ5T2N8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATAD3CQ5T2N8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATAD3CQ5T2N8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATAD3CQ5T2N8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATAD3CQ5T2N8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATAD3CQ5T2N8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATAD3CQ5T2N8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATAD3CQ5T2N8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATAD3CQ5T2N8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATAD3CQ5T2N8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATAD3CQ5T2N8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATAD3CQ5T2N8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATAD3CQ5T2N8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATAD3CQ5T2N8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATAD3CQ5T2N8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATAD3CQ5T2N8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATAD3CQ5T2N8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATAD3CQ5T2N8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATAD3CQ5T2N8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATAD3CQ5T2N8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATAD3CQ5T2N8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATAD3CQ5T2N8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ATAD3CQ5T2N8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATAD3CQ5T2N8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATAD3CQ5T2N8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATAD3CQ5T2N8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATAD3CQ5T2N8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATAD3CQ5T2N8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATAD3CQ5T2N8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATAD3CQ5T2N8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATAD3CQ5T2N8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATAD3CQ5T2N8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATAD3CQ5T2N8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATAD3CQ5T2N8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAD3CQ5T2N8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAD3CQ5T2N8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATAD3CQ5T2N8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATAD3CQ5T2N8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATAD3CQ5T2N8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD3CQ5T2N8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD3CQ5T2N8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD3CQ5T2N8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD3CQ5T2N8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD3CQ5T2N8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD3CQ5T2N8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD3CQ5T2N8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD3CQ5T2N8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD3CQ5T2N8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD3CQ5T2N8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD3CQ5T2N8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD3CQ5T2N8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD3CQ5T2N8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD3CQ5T2N8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD3CQ5T2N8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAD3CQ5T2N8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAD3CQ5T2N8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAD3CQ5T2N8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAD3CQ5T2N8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAD3CQ5T2N8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAD3CQ5T2N8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAD3CQ5T2N8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAD3CQ5T2N8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAD3CQ5T2N8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATAD3CQ5T2N8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATAD3CQ5T2N8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATAD3CQ5T2N8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATAD3CQ5T2N8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATAD3CQ5T2N8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATAD3CQ5T2N8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATAD3CQ5T2N8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATAD3CQ5T2N8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATAD3CQ5T2N8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATAD3CQ5T2N8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATAD3CQ5T2N8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATAD3CQ5T2N8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATAD3CQ5T2N8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATAD3CQ5T2N8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms