Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTSL3PQ5NE16 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTSL3PQ5NE16 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTSL3PQ5NE16 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTSL3PQ5NE16 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTSL3PQ5NE16 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTSL3PQ5NE16 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTSL3PQ5NE16 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTSL3PQ5NE16 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTSL3PQ5NE16 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTSL3PQ5NE16 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTSL3PQ5NE16 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CTSL3PQ5NE16 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTSL3PQ5NE16 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTSL3PQ5NE16 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTSL3PQ5NE16 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CTSL3PQ5NE16 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTSL3PQ5NE16 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CTSL3PQ5NE16 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTSL3PQ5NE16 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTSL3PQ5NE16 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTSL3PQ5NE16 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTSL3PQ5NE16 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTSL3PQ5NE16 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTSL3PQ5NE16 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTSL3PQ5NE16 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTSL3PQ5NE16 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTSL3PQ5NE16 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTSL3PQ5NE16 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTSL3PQ5NE16 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTSL3PQ5NE16 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTSL3PQ5NE16 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTSL3PQ5NE16 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTSL3PQ5NE16 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CTSL3PQ5NE16 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CTSL3PQ5NE16 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTSL3PQ5NE16 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTSL3PQ5NE16 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CTSL3PQ5NE16 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTSL3PQ5NE16 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTSL3PQ5NE16 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTSL3PQ5NE16 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTSL3PQ5NE16 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTSL3PQ5NE16 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTSL3PQ5NE16 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTSL3PQ5NE16 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTSL3PQ5NE16 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTSL3PQ5NE16 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTSL3PQ5NE16 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTSL3PQ5NE16 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTSL3PQ5NE16 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTSL3PQ5NE16 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTSL3PQ5NE16 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTSL3PQ5NE16 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTSL3PQ5NE16 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CTSL3PQ5NE16 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTSL3PQ5NE16 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CTSL3PQ5NE16 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTSL3PQ5NE16 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTSL3PQ5NE16 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTSL3PQ5NE16 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTSL3PQ5NE16 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTSL3PQ5NE16 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTSL3PQ5NE16 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTSL3PQ5NE16 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTSL3PQ5NE16 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTSL3PQ5NE16 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTSL3PQ5NE16 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTSL3PQ5NE16 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTSL3PQ5NE16 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTSL3PQ5NE16 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTSL3PQ5NE16 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTSL3PQ5NE16 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTSL3PQ5NE16 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTSL3PQ5NE16 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTSL3PQ5NE16 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CTSL3PQ5NE16 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTSL3PQ5NE16 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTSL3PQ5NE16 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTSL3PQ5NE16 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTSL3PQ5NE16 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CTSL3PQ5NE16 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTSL3PQ5NE16 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTSL3PQ5NE16 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTSL3PQ5NE16 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTSL3PQ5NE16 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTSL3PQ5NE16 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTSL3PQ5NE16 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTSL3PQ5NE16 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTSL3PQ5NE16 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTSL3PQ5NE16 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTSL3PQ5NE16 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTSL3PQ5NE16 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CTSL3PQ5NE16 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTSL3PQ5NE16 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTSL3PQ5NE16 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CTSL3PQ5NE16 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTSL3PQ5NE16 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTSL3PQ5NE16 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTSL3PQ5NE16 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms