Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTU2Q2VPK5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTU2Q2VPK5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTU2Q2VPK5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTU2Q2VPK5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTU2Q2VPK5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTU2Q2VPK5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTU2Q2VPK5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTU2Q2VPK5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTU2Q2VPK5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTU2Q2VPK5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTU2Q2VPK5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTU2Q2VPK5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTU2Q2VPK5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTU2Q2VPK5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTU2Q2VPK5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CTU2Q2VPK5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTU2Q2VPK5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTU2Q2VPK5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTU2Q2VPK5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTU2Q2VPK5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTU2Q2VPK5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTU2Q2VPK5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTU2Q2VPK5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTU2Q2VPK5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTU2Q2VPK5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTU2Q2VPK5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTU2Q2VPK5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTU2Q2VPK5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTU2Q2VPK5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTU2Q2VPK5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTU2Q2VPK5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTU2Q2VPK5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTU2Q2VPK5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTU2Q2VPK5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTU2Q2VPK5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTU2Q2VPK5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTU2Q2VPK5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTU2Q2VPK5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTU2Q2VPK5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTU2Q2VPK5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTU2Q2VPK5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTU2Q2VPK5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTU2Q2VPK5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTU2Q2VPK5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTU2Q2VPK5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTU2Q2VPK5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTU2Q2VPK5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTU2Q2VPK5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTU2Q2VPK5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTU2Q2VPK5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTU2Q2VPK5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTU2Q2VPK5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTU2Q2VPK5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTU2Q2VPK5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTU2Q2VPK5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTU2Q2VPK5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTU2Q2VPK5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTU2Q2VPK5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTU2Q2VPK5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTU2Q2VPK5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTU2Q2VPK5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTU2Q2VPK5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTU2Q2VPK5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CTU2Q2VPK5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTU2Q2VPK5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTU2Q2VPK5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTU2Q2VPK5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTU2Q2VPK5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTU2Q2VPK5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTU2Q2VPK5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTU2Q2VPK5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTU2Q2VPK5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTU2Q2VPK5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTU2Q2VPK5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTU2Q2VPK5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTU2Q2VPK5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTU2Q2VPK5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTU2Q2VPK5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CTU2Q2VPK5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTU2Q2VPK5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTU2Q2VPK5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTU2Q2VPK5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTU2Q2VPK5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTU2Q2VPK5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTU2Q2VPK5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTU2Q2VPK5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTU2Q2VPK5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTU2Q2VPK5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTU2Q2VPK5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTU2Q2VPK5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTU2Q2VPK5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTU2Q2VPK5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CTU2Q2VPK5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTU2Q2VPK5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTU2Q2VPK5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTU2Q2VPK5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTU2Q2VPK5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTU2Q2VPK5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTU2Q2VPK5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
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