Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LONRF1Q17RB8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LONRF1Q17RB8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LONRF1Q17RB8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LONRF1Q17RB8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LONRF1Q17RB8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LONRF1Q17RB8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LONRF1Q17RB8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LONRF1Q17RB8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LONRF1Q17RB8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LONRF1Q17RB8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LONRF1Q17RB8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LONRF1Q17RB8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LONRF1Q17RB8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LONRF1Q17RB8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LONRF1Q17RB8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LONRF1Q17RB8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LONRF1Q17RB8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LONRF1Q17RB8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LONRF1Q17RB8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LONRF1Q17RB8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LONRF1Q17RB8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LONRF1Q17RB8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LONRF1Q17RB8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LONRF1Q17RB8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LONRF1Q17RB8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LONRF1Q17RB8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LONRF1Q17RB8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LONRF1Q17RB8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LONRF1Q17RB8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LONRF1Q17RB8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LONRF1Q17RB8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LONRF1Q17RB8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LONRF1Q17RB8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LONRF1Q17RB8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LONRF1Q17RB8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LONRF1Q17RB8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LONRF1Q17RB8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LONRF1Q17RB8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LONRF1Q17RB8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LONRF1Q17RB8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LONRF1Q17RB8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LONRF1Q17RB8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LONRF1Q17RB8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LONRF1Q17RB8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LONRF1Q17RB8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LONRF1Q17RB8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LONRF1Q17RB8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LONRF1Q17RB8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LONRF1Q17RB8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LONRF1Q17RB8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LONRF1Q17RB8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LONRF1Q17RB8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LONRF1Q17RB8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LONRF1Q17RB8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LONRF1Q17RB8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LONRF1Q17RB8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LONRF1Q17RB8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LONRF1Q17RB8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LONRF1Q17RB8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LONRF1Q17RB8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
LONRF1Q17RB8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LONRF1Q17RB8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LONRF1Q17RB8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LONRF1Q17RB8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LONRF1Q17RB8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LONRF1Q17RB8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LONRF1Q17RB8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LONRF1Q17RB8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LONRF1Q17RB8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LONRF1Q17RB8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LONRF1Q17RB8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LONRF1Q17RB8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LONRF1Q17RB8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LONRF1Q17RB8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LONRF1Q17RB8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LONRF1Q17RB8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LONRF1Q17RB8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LONRF1Q17RB8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LONRF1Q17RB8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LONRF1Q17RB8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LONRF1Q17RB8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LONRF1Q17RB8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LONRF1Q17RB8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LONRF1Q17RB8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LONRF1Q17RB8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LONRF1Q17RB8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LONRF1Q17RB8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LONRF1Q17RB8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LONRF1Q17RB8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LONRF1Q17RB8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LONRF1Q17RB8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LONRF1Q17RB8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LONRF1Q17RB8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LONRF1Q17RB8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LONRF1Q17RB8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LONRF1Q17RB8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LONRF1Q17RB8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LONRF1Q17RB8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LONRF1Q17RB8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
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