Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PEX6Q13608 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PEX6Q13608 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PEX6Q13608 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PEX6Q13608 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PEX6Q13608 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PEX6Q13608 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PEX6Q13608 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PEX6Q13608 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PEX6Q13608 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PEX6Q13608 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PEX6Q13608 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PEX6Q13608 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PEX6Q13608 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PEX6Q13608 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PEX6Q13608 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PEX6Q13608 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PEX6Q13608 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PEX6Q13608 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PEX6Q13608 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PEX6Q13608 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PEX6Q13608 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PEX6Q13608 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PEX6Q13608 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PEX6Q13608 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PEX6Q13608 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PEX6Q13608 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PEX6Q13608 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PEX6Q13608 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PEX6Q13608 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PEX6Q13608 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PEX6Q13608 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PEX6Q13608 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PEX6Q13608 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PEX6Q13608 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PEX6Q13608 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PEX6Q13608 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PEX6Q13608 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PEX6Q13608 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PEX6Q13608 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PEX6Q13608 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PEX6Q13608 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PEX6Q13608 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PEX6Q13608 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PEX6Q13608 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PEX6Q13608 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PEX6Q13608 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PEX6Q13608 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PEX6Q13608 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PEX6Q13608 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PEX6Q13608 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PEX6Q13608 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PEX6Q13608 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PEX6Q13608 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PEX6Q13608 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PEX6Q13608 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PEX6Q13608 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PEX6Q13608 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PEX6Q13608 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PEX6Q13608 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PEX6Q13608 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PEX6Q13608 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PEX6Q13608 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PEX6Q13608 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PEX6Q13608 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PEX6Q13608 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PEX6Q13608 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PEX6Q13608 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PEX6Q13608 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PEX6Q13608 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PEX6Q13608 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PEX6Q13608 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PEX6Q13608 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PEX6Q13608 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PEX6Q13608 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PEX6Q13608 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PEX6Q13608 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PEX6Q13608 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PEX6Q13608 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PEX6Q13608 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PEX6Q13608 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PEX6Q13608 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PEX6Q13608 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PEX6Q13608 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PEX6Q13608 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PEX6Q13608 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PEX6Q13608 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PEX6Q13608 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PEX6Q13608 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PEX6Q13608 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PEX6Q13608 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PEX6Q13608 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PEX6Q13608 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PEX6Q13608 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PEX6Q13608 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PEX6Q13608 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PEX6Q13608 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PEX6Q13608 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PEX6Q13608 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PEX6Q13608 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
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