Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BNC1Q01954 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BNC1Q01954 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BNC1Q01954 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BNC1Q01954 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BNC1Q01954 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BNC1Q01954 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BNC1Q01954 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BNC1Q01954 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BNC1Q01954 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BNC1Q01954 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BNC1Q01954 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BNC1Q01954 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BNC1Q01954 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BNC1Q01954 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BNC1Q01954 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BNC1Q01954 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BNC1Q01954 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BNC1Q01954 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
BNC1Q01954 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
BNC1Q01954 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BNC1Q01954 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BNC1Q01954 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
BNC1Q01954 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
BNC1Q01954 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
BNC1Q01954 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
BNC1Q01954 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
BNC1Q01954 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
BNC1Q01954 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
BNC1Q01954 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
BNC1Q01954 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
BNC1Q01954 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BNC1Q01954 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BNC1Q01954 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BNC1Q01954 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BNC1Q01954 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BNC1Q01954 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BNC1Q01954 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BNC1Q01954 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BNC1Q01954 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BNC1Q01954 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
BNC1Q01954 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
BNC1Q01954 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BNC1Q01954 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BNC1Q01954 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BNC1Q01954 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BNC1Q01954 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BNC1Q01954 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BNC1Q01954 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BNC1Q01954 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BNC1Q01954 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BNC1Q01954 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BNC1Q01954 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BNC1Q01954 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BNC1Q01954 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BNC1Q01954 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BNC1Q01954 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BNC1Q01954 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BNC1Q01954 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BNC1Q01954 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BNC1Q01954 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BNC1Q01954 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BNC1Q01954 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BNC1Q01954 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BNC1Q01954 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BNC1Q01954 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BNC1Q01954 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BNC1Q01954 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BNC1Q01954 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BNC1Q01954 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BNC1Q01954 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BNC1Q01954 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BNC1Q01954 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BNC1Q01954 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BNC1Q01954 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BNC1Q01954 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BNC1Q01954 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BNC1Q01954 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BNC1Q01954 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BNC1Q01954 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BNC1Q01954 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BNC1Q01954 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BNC1Q01954 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BNC1Q01954 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BNC1Q01954 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BNC1Q01954 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BNC1Q01954 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BNC1Q01954 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BNC1Q01954 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BNC1Q01954 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BNC1Q01954 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BNC1Q01954 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BNC1Q01954 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BNC1Q01954 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BNC1Q01954 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BNC1Q01954 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BNC1Q01954 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BNC1Q01954 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BNC1Q01954 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BNC1Q01954 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms