Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.06
BNC1Q01954 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
BNC1Q01954 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
BNC1Q01954 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
BNC1Q01954 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
BNC1Q01954 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
BNC1Q01954 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
BNC1Q01954 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
BNC1Q01954 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
BNC1Q01954 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
BNC1Q01954 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
BNC1Q01954 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
BNC1Q01954 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
BNC1Q01954 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
BNC1Q01954 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
BNC1Q01954 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
BNC1Q01954 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
BNC1Q01954 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
BNC1Q01954 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
BNC1Q01954 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
BNC1Q01954 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
BNC1Q01954 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
BNC1Q01954 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
BNC1Q01954 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
BNC1Q01954 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
BNC1Q01954 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
BNC1Q01954 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
BNC1Q01954 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
BNC1Q01954 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
BNC1Q01954 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
BNC1Q01954 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
BNC1Q01954 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
BNC1Q01954 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
BNC1Q01954 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
BNC1Q01954 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
BNC1Q01954 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
BNC1Q01954 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
BNC1Q01954 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
BNC1Q01954 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
BNC1Q01954 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
BNC1Q01954 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
BNC1Q01954 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
BNC1Q01954 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BNC1Q01954 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
BNC1Q01954 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
BNC1Q01954 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
BNC1Q01954 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
BNC1Q01954 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
BNC1Q01954 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BNC1Q01954 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
BNC1Q01954 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
BNC1Q01954 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
BNC1Q01954 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BNC1Q01954 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
BNC1Q01954 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BNC1Q01954 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BNC1Q01954 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
BNC1Q01954 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BNC1Q01954 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BNC1Q01954 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BNC1Q01954 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BNC1Q01954 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BNC1Q01954 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
BNC1Q01954 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BNC1Q01954 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BNC1Q01954 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BNC1Q01954 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BNC1Q01954 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BNC1Q01954 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BNC1Q01954 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
BNC1Q01954 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BNC1Q01954 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BNC1Q01954 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BNC1Q01954 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BNC1Q01954 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BNC1Q01954 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
BNC1Q01954 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
BNC1Q01954 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BNC1Q01954 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BNC1Q01954 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BNC1Q01954 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BNC1Q01954 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
BNC1Q01954 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
BNC1Q01954 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BNC1Q01954 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BNC1Q01954 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BNC1Q01954 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BNC1Q01954 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BNC1Q01954 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
BNC1Q01954 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BNC1Q01954 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BNC1Q01954 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BNC1Q01954 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BNC1Q01954 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
BNC1Q01954 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BNC1Q01954 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BNC1Q01954 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BNC1Q01954 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BNC1Q01954 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BNC1Q01954 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms