Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01547P58512 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01547P58512 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01547P58512 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01547P58512 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01547P58512 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01547P58512 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01547P58512 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01547P58512 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01547P58512 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01547P58512 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01547P58512 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01547P58512 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01547P58512 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01547P58512 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01547P58512 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01547P58512 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01547P58512 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01547P58512 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01547P58512 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01547P58512 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01547P58512 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01547P58512 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01547P58512 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01547P58512 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01547P58512 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01547P58512 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC01547P58512 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01547P58512 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01547P58512 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01547P58512 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01547P58512 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01547P58512 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01547P58512 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01547P58512 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01547P58512 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01547P58512 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01547P58512 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01547P58512 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01547P58512 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01547P58512 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01547P58512 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01547P58512 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01547P58512 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01547P58512 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01547P58512 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01547P58512 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01547P58512 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC01547P58512 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC01547P58512 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01547P58512 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01547P58512 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC01547P58512 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01547P58512 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01547P58512 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01547P58512 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01547P58512 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01547P58512 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC01547P58512 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01547P58512 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01547P58512 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01547P58512 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01547P58512 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01547P58512 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01547P58512 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01547P58512 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01547P58512 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01547P58512 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01547P58512 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01547P58512 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC01547P58512 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01547P58512 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01547P58512 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01547P58512 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01547P58512 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01547P58512 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01547P58512 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01547P58512 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01547P58512 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01547P58512 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01547P58512 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01547P58512 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01547P58512 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01547P58512 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01547P58512 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01547P58512 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01547P58512 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01547P58512 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01547P58512 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01547P58512 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01547P58512 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01547P58512 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01547P58512 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01547P58512 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01547P58512 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01547P58512 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01547P58512 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01547P58512 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01547P58512 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC01547P58512 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms