Protein–RNA interactions for Protein: P51812

RPS6KA3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA3P51812 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPS6KA3P51812 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPS6KA3P51812 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPS6KA3P51812 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RPS6KA3P51812 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPS6KA3P51812 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPS6KA3P51812 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPS6KA3P51812 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS6KA3P51812 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS6KA3P51812 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS6KA3P51812 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPS6KA3P51812 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPS6KA3P51812 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KA3P51812 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KA3P51812 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KA3P51812 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KA3P51812 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPS6KA3P51812 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPS6KA3P51812 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KA3P51812 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KA3P51812 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KA3P51812 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KA3P51812 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KA3P51812 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KA3P51812 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KA3P51812 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KA3P51812 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KA3P51812 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KA3P51812 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KA3P51812 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KA3P51812 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KA3P51812 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KA3P51812 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KA3P51812 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KA3P51812 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KA3P51812 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KA3P51812 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KA3P51812 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KA3P51812 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KA3P51812 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KA3P51812 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KA3P51812 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KA3P51812 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KA3P51812 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KA3P51812 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KA3P51812 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KA3P51812 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KA3P51812 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KA3P51812 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KA3P51812 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS6KA3P51812 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS6KA3P51812 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KA3P51812 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KA3P51812 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KA3P51812 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KA3P51812 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KA3P51812 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KA3P51812 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KA3P51812 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KA3P51812 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KA3P51812 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KA3P51812 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS6KA3P51812 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KA3P51812 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KA3P51812 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KA3P51812 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KA3P51812 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RPS6KA3P51812 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KA3P51812 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KA3P51812 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KA3P51812 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KA3P51812 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KA3P51812 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KA3P51812 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KA3P51812 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KA3P51812 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KA3P51812 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KA3P51812 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KA3P51812 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KA3P51812 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KA3P51812 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KA3P51812 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KA3P51812 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KA3P51812 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPS6KA3P51812 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KA3P51812 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KA3P51812 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KA3P51812 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KA3P51812 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPS6KA3P51812 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPS6KA3P51812 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KA3P51812 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KA3P51812 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KA3P51812 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KA3P51812 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA3P51812 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA3P51812 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KA3P51812 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KA3P51812 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KA3P51812 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms