Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ERFP50548 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERFP50548 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERFP50548 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERFP50548 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERFP50548 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERFP50548 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ERFP50548 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERFP50548 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERFP50548 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERFP50548 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERFP50548 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERFP50548 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERFP50548 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERFP50548 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERFP50548 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERFP50548 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERFP50548 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERFP50548 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERFP50548 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERFP50548 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERFP50548 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERFP50548 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERFP50548 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERFP50548 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERFP50548 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERFP50548 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERFP50548 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERFP50548 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERFP50548 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERFP50548 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERFP50548 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ERFP50548 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERFP50548 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERFP50548 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERFP50548 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERFP50548 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERFP50548 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERFP50548 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERFP50548 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ERFP50548 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERFP50548 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERFP50548 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERFP50548 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERFP50548 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERFP50548 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERFP50548 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERFP50548 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERFP50548 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERFP50548 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERFP50548 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERFP50548 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERFP50548 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERFP50548 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERFP50548 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERFP50548 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERFP50548 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERFP50548 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERFP50548 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERFP50548 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ERFP50548 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERFP50548 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERFP50548 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERFP50548 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERFP50548 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERFP50548 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERFP50548 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERFP50548 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERFP50548 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERFP50548 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ERFP50548 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ERFP50548 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ERFP50548 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERFP50548 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERFP50548 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERFP50548 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERFP50548 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERFP50548 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERFP50548 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERFP50548 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERFP50548 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERFP50548 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERFP50548 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERFP50548 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERFP50548 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERFP50548 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERFP50548 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERFP50548 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERFP50548 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERFP50548 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERFP50548 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERFP50548 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERFP50548 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERFP50548 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERFP50548 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERFP50548 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERFP50548 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERFP50548 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERFP50548 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERFP50548 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms