Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KRT2P35908 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KRT2P35908 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
KRT2P35908 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
KRT2P35908 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
KRT2P35908 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
KRT2P35908 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
KRT2P35908 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
KRT2P35908 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
KRT2P35908 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
KRT2P35908 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KRT2P35908 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
KRT2P35908 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KRT2P35908 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KRT2P35908 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KRT2P35908 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KRT2P35908 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
KRT2P35908 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KRT2P35908 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
KRT2P35908 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
KRT2P35908 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
KRT2P35908 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
KRT2P35908 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
KRT2P35908 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
KRT2P35908 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
KRT2P35908 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
KRT2P35908 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
KRT2P35908 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
KRT2P35908 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
KRT2P35908 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
KRT2P35908 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
KRT2P35908 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
KRT2P35908 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
KRT2P35908 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
KRT2P35908 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
KRT2P35908 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
KRT2P35908 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
KRT2P35908 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
KRT2P35908 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
KRT2P35908 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
KRT2P35908 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
KRT2P35908 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
KRT2P35908 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
KRT2P35908 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
KRT2P35908 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
KRT2P35908 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KRT2P35908 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KRT2P35908 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KRT2P35908 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KRT2P35908 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KRT2P35908 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
KRT2P35908 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
KRT2P35908 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KRT2P35908 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KRT2P35908 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KRT2P35908 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KRT2P35908 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KRT2P35908 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KRT2P35908 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KRT2P35908 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
KRT2P35908 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
KRT2P35908 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
KRT2P35908 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
KRT2P35908 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
KRT2P35908 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
KRT2P35908 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
KRT2P35908 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KRT2P35908 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KRT2P35908 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KRT2P35908 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KRT2P35908 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KRT2P35908 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
KRT2P35908 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
KRT2P35908 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KRT2P35908 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KRT2P35908 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KRT2P35908 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KRT2P35908 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KRT2P35908 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KRT2P35908 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KRT2P35908 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KRT2P35908 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KRT2P35908 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KRT2P35908 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KRT2P35908 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KRT2P35908 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
KRT2P35908 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
KRT2P35908 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
KRT2P35908 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KRT2P35908 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KRT2P35908 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KRT2P35908 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KRT2P35908 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
KRT2P35908 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KRT2P35908 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
KRT2P35908 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KRT2P35908 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
KRT2P35908 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KRT2P35908 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KRT2P35908 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms