Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD34P28906 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD34P28906 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD34P28906 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD34P28906 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD34P28906 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CD34P28906 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD34P28906 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD34P28906 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD34P28906 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD34P28906 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD34P28906 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD34P28906 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD34P28906 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD34P28906 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD34P28906 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD34P28906 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD34P28906 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD34P28906 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD34P28906 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD34P28906 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD34P28906 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD34P28906 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD34P28906 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD34P28906 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD34P28906 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD34P28906 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD34P28906 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD34P28906 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD34P28906 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD34P28906 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD34P28906 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD34P28906 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CD34P28906 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CD34P28906 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD34P28906 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD34P28906 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD34P28906 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD34P28906 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD34P28906 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD34P28906 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD34P28906 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD34P28906 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD34P28906 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD34P28906 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD34P28906 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD34P28906 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD34P28906 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CD34P28906 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD34P28906 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD34P28906 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD34P28906 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD34P28906 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD34P28906 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD34P28906 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD34P28906 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CD34P28906 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD34P28906 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD34P28906 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD34P28906 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD34P28906 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD34P28906 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD34P28906 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD34P28906 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD34P28906 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD34P28906 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD34P28906 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD34P28906 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CD34P28906 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD34P28906 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD34P28906 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CD34P28906 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD34P28906 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD34P28906 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD34P28906 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD34P28906 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD34P28906 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD34P28906 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD34P28906 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD34P28906 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD34P28906 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD34P28906 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD34P28906 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD34P28906 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CD34P28906 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD34P28906 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD34P28906 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CD34P28906 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD34P28906 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD34P28906 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD34P28906 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD34P28906 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD34P28906 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD34P28906 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD34P28906 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD34P28906 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD34P28906 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD34P28906 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD34P28906 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD34P28906 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms