Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NTF3P20783 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NTF3P20783 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NTF3P20783 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NTF3P20783 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NTF3P20783 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NTF3P20783 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NTF3P20783 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NTF3P20783 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NTF3P20783 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NTF3P20783 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTF3P20783 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTF3P20783 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTF3P20783 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTF3P20783 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTF3P20783 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NTF3P20783 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NTF3P20783 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NTF3P20783 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NTF3P20783 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NTF3P20783 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NTF3P20783 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NTF3P20783 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NTF3P20783 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NTF3P20783 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NTF3P20783 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NTF3P20783 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NTF3P20783 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NTF3P20783 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NTF3P20783 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NTF3P20783 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NTF3P20783 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NTF3P20783 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NTF3P20783 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NTF3P20783 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NTF3P20783 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NTF3P20783 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NTF3P20783 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NTF3P20783 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NTF3P20783 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NTF3P20783 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NTF3P20783 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NTF3P20783 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NTF3P20783 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NTF3P20783 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NTF3P20783 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NTF3P20783 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NTF3P20783 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NTF3P20783 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NTF3P20783 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NTF3P20783 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NTF3P20783 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NTF3P20783 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NTF3P20783 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NTF3P20783 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTF3P20783 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTF3P20783 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NTF3P20783 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTF3P20783 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTF3P20783 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTF3P20783 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NTF3P20783 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTF3P20783 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTF3P20783 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NTF3P20783 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTF3P20783 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTF3P20783 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTF3P20783 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTF3P20783 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NTF3P20783 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTF3P20783 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTF3P20783 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NTF3P20783 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NTF3P20783 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NTF3P20783 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NTF3P20783 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NTF3P20783 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NTF3P20783 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NTF3P20783 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NTF3P20783 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NTF3P20783 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NTF3P20783 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NTF3P20783 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NTF3P20783 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NTF3P20783 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NTF3P20783 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NTF3P20783 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NTF3P20783 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NTF3P20783 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NTF3P20783 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NTF3P20783 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NTF3P20783 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NTF3P20783 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTF3P20783 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTF3P20783 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NTF3P20783 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NTF3P20783 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NTF3P20783 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTF3P20783 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NTF3P20783 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms