Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RARGP13631 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RARGP13631 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RARGP13631 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RARGP13631 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RARGP13631 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RARGP13631 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RARGP13631 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RARGP13631 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RARGP13631 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RARGP13631 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RARGP13631 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RARGP13631 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RARGP13631 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RARGP13631 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RARGP13631 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RARGP13631 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RARGP13631 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RARGP13631 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RARGP13631 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RARGP13631 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RARGP13631 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RARGP13631 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RARGP13631 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RARGP13631 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RARGP13631 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RARGP13631 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RARGP13631 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RARGP13631 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RARGP13631 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RARGP13631 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RARGP13631 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RARGP13631 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RARGP13631 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RARGP13631 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RARGP13631 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RARGP13631 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RARGP13631 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RARGP13631 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RARGP13631 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RARGP13631 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RARGP13631 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RARGP13631 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RARGP13631 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RARGP13631 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RARGP13631 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RARGP13631 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RARGP13631 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RARGP13631 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RARGP13631 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RARGP13631 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RARGP13631 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RARGP13631 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RARGP13631 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RARGP13631 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RARGP13631 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RARGP13631 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RARGP13631 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RARGP13631 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RARGP13631 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RARGP13631 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RARGP13631 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RARGP13631 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RARGP13631 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RARGP13631 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RARGP13631 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RARGP13631 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RARGP13631 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RARGP13631 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RARGP13631 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RARGP13631 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RARGP13631 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RARGP13631 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RARGP13631 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RARGP13631 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RARGP13631 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RARGP13631 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RARGP13631 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RARGP13631 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RARGP13631 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RARGP13631 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RARGP13631 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RARGP13631 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RARGP13631 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RARGP13631 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RARGP13631 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RARGP13631 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RARGP13631 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RARGP13631 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RARGP13631 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RARGP13631 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RARGP13631 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RARGP13631 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RARGP13631 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RARGP13631 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RARGP13631 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RARGP13631 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RARGP13631 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RARGP13631 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RARGP13631 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.8 ms