Protein–RNA interactions for Protein: P0C6S8

LINGO3, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO3P0C6S8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINGO3P0C6S8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINGO3P0C6S8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINGO3P0C6S8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINGO3P0C6S8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINGO3P0C6S8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINGO3P0C6S8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINGO3P0C6S8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINGO3P0C6S8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINGO3P0C6S8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LINGO3P0C6S8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINGO3P0C6S8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINGO3P0C6S8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINGO3P0C6S8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINGO3P0C6S8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINGO3P0C6S8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINGO3P0C6S8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINGO3P0C6S8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINGO3P0C6S8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINGO3P0C6S8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LINGO3P0C6S8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LINGO3P0C6S8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LINGO3P0C6S8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINGO3P0C6S8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINGO3P0C6S8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINGO3P0C6S8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINGO3P0C6S8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINGO3P0C6S8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LINGO3P0C6S8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINGO3P0C6S8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINGO3P0C6S8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINGO3P0C6S8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINGO3P0C6S8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINGO3P0C6S8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINGO3P0C6S8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINGO3P0C6S8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINGO3P0C6S8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINGO3P0C6S8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LINGO3P0C6S8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINGO3P0C6S8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINGO3P0C6S8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINGO3P0C6S8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINGO3P0C6S8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINGO3P0C6S8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINGO3P0C6S8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINGO3P0C6S8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINGO3P0C6S8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINGO3P0C6S8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINGO3P0C6S8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINGO3P0C6S8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINGO3P0C6S8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINGO3P0C6S8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINGO3P0C6S8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LINGO3P0C6S8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LINGO3P0C6S8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LINGO3P0C6S8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LINGO3P0C6S8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINGO3P0C6S8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINGO3P0C6S8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINGO3P0C6S8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINGO3P0C6S8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINGO3P0C6S8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINGO3P0C6S8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINGO3P0C6S8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINGO3P0C6S8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINGO3P0C6S8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINGO3P0C6S8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LINGO3P0C6S8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINGO3P0C6S8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINGO3P0C6S8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINGO3P0C6S8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINGO3P0C6S8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINGO3P0C6S8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINGO3P0C6S8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINGO3P0C6S8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINGO3P0C6S8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LINGO3P0C6S8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINGO3P0C6S8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINGO3P0C6S8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINGO3P0C6S8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINGO3P0C6S8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINGO3P0C6S8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINGO3P0C6S8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINGO3P0C6S8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINGO3P0C6S8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LINGO3P0C6S8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LINGO3P0C6S8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LINGO3P0C6S8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LINGO3P0C6S8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LINGO3P0C6S8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINGO3P0C6S8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINGO3P0C6S8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINGO3P0C6S8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINGO3P0C6S8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINGO3P0C6S8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LINGO3P0C6S8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINGO3P0C6S8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINGO3P0C6S8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINGO3P0C6S8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINGO3P0C6S8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms