Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNA4P05014 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNA4P05014 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNA4P05014 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNA4P05014 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNA4P05014 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNA4P05014 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNA4P05014 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNA4P05014 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNA4P05014 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNA4P05014 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNA4P05014 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNA4P05014 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IFNA4P05014 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IFNA4P05014 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IFNA4P05014 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNA4P05014 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IFNA4P05014 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFNA4P05014 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFNA4P05014 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFNA4P05014 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IFNA4P05014 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IFNA4P05014 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNA4P05014 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IFNA4P05014 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNA4P05014 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNA4P05014 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNA4P05014 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNA4P05014 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNA4P05014 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IFNA4P05014 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNA4P05014 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNA4P05014 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNA4P05014 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNA4P05014 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNA4P05014 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNA4P05014 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNA4P05014 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNA4P05014 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNA4P05014 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNA4P05014 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNA4P05014 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNA4P05014 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNA4P05014 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNA4P05014 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNA4P05014 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNA4P05014 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNA4P05014 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNA4P05014 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFNA4P05014 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFNA4P05014 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFNA4P05014 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFNA4P05014 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFNA4P05014 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFNA4P05014 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFNA4P05014 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFNA4P05014 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFNA4P05014 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFNA4P05014 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFNA4P05014 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFNA4P05014 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFNA4P05014 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFNA4P05014 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFNA4P05014 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFNA4P05014 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
IFNA4P05014 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFNA4P05014 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFNA4P05014 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFNA4P05014 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFNA4P05014 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFNA4P05014 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFNA4P05014 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFNA4P05014 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFNA4P05014 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFNA4P05014 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFNA4P05014 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFNA4P05014 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFNA4P05014 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFNA4P05014 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFNA4P05014 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
IFNA4P05014 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IFNA4P05014 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNA4P05014 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNA4P05014 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNA4P05014 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNA4P05014 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNA4P05014 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNA4P05014 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNA4P05014 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNA4P05014 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNA4P05014 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNA4P05014 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFNA4P05014 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNA4P05014 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNA4P05014 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNA4P05014 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFNA4P05014 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNA4P05014 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNA4P05014 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFNA4P05014 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms