Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPFIA2O75334 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPFIA2O75334 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPFIA2O75334 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPFIA2O75334 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PPFIA2O75334 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPFIA2O75334 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPFIA2O75334 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPFIA2O75334 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPFIA2O75334 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPFIA2O75334 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPFIA2O75334 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPFIA2O75334 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPFIA2O75334 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPFIA2O75334 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPFIA2O75334 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPFIA2O75334 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPFIA2O75334 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPFIA2O75334 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PPFIA2O75334 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPFIA2O75334 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPFIA2O75334 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPFIA2O75334 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPFIA2O75334 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPFIA2O75334 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPFIA2O75334 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPFIA2O75334 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPFIA2O75334 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPFIA2O75334 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPFIA2O75334 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPFIA2O75334 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPFIA2O75334 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PPFIA2O75334 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPFIA2O75334 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPFIA2O75334 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPFIA2O75334 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPFIA2O75334 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPFIA2O75334 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PPFIA2O75334 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPFIA2O75334 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PPFIA2O75334 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPFIA2O75334 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PPFIA2O75334 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPFIA2O75334 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PPFIA2O75334 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPFIA2O75334 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPFIA2O75334 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPFIA2O75334 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPFIA2O75334 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPFIA2O75334 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPFIA2O75334 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPFIA2O75334 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PPFIA2O75334 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPFIA2O75334 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPFIA2O75334 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPFIA2O75334 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPFIA2O75334 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPFIA2O75334 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PPFIA2O75334 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPFIA2O75334 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PPFIA2O75334 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPFIA2O75334 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPFIA2O75334 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPFIA2O75334 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPFIA2O75334 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPFIA2O75334 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPFIA2O75334 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPFIA2O75334 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPFIA2O75334 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PPFIA2O75334 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPFIA2O75334 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPFIA2O75334 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPFIA2O75334 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPFIA2O75334 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPFIA2O75334 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPFIA2O75334 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPFIA2O75334 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PPFIA2O75334 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPFIA2O75334 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPFIA2O75334 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPFIA2O75334 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPFIA2O75334 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PPFIA2O75334 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPFIA2O75334 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPFIA2O75334 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPFIA2O75334 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPFIA2O75334 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPFIA2O75334 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPFIA2O75334 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPFIA2O75334 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPFIA2O75334 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPFIA2O75334 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPFIA2O75334 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPFIA2O75334 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPFIA2O75334 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPFIA2O75334 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPFIA2O75334 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPFIA2O75334 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPFIA2O75334 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPFIA2O75334 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms