Protein–RNA interactions for Protein: O43709

BUD23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23O43709 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BUD23O43709 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BUD23O43709 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BUD23O43709 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BUD23O43709 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BUD23O43709 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BUD23O43709 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BUD23O43709 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BUD23O43709 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BUD23O43709 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BUD23O43709 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BUD23O43709 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BUD23O43709 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BUD23O43709 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BUD23O43709 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BUD23O43709 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BUD23O43709 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BUD23O43709 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BUD23O43709 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BUD23O43709 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BUD23O43709 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BUD23O43709 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BUD23O43709 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BUD23O43709 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
BUD23O43709 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BUD23O43709 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BUD23O43709 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BUD23O43709 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
BUD23O43709 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BUD23O43709 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BUD23O43709 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BUD23O43709 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BUD23O43709 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BUD23O43709 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BUD23O43709 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BUD23O43709 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BUD23O43709 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BUD23O43709 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BUD23O43709 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
BUD23O43709 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
BUD23O43709 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BUD23O43709 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BUD23O43709 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BUD23O43709 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BUD23O43709 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BUD23O43709 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BUD23O43709 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BUD23O43709 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BUD23O43709 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BUD23O43709 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BUD23O43709 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BUD23O43709 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BUD23O43709 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BUD23O43709 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BUD23O43709 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BUD23O43709 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
BUD23O43709 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BUD23O43709 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BUD23O43709 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BUD23O43709 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BUD23O43709 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BUD23O43709 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BUD23O43709 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BUD23O43709 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
BUD23O43709 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
BUD23O43709 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BUD23O43709 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BUD23O43709 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BUD23O43709 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BUD23O43709 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BUD23O43709 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BUD23O43709 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BUD23O43709 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BUD23O43709 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BUD23O43709 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BUD23O43709 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BUD23O43709 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BUD23O43709 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BUD23O43709 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BUD23O43709 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BUD23O43709 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BUD23O43709 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BUD23O43709 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BUD23O43709 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BUD23O43709 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BUD23O43709 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BUD23O43709 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BUD23O43709 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
BUD23O43709 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BUD23O43709 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BUD23O43709 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BUD23O43709 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BUD23O43709 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BUD23O43709 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BUD23O43709 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BUD23O43709 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
BUD23O43709 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BUD23O43709 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
BUD23O43709 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BUD23O43709 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms