Protein–RNA interactions for Protein: J3QR06

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR06 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QR06 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QR06 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QR06 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QR06 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QR06 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QR06 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
J3QR06 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3QR06 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3QR06 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3QR06 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3QR06 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3QR06 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3QR06 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3QR06 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3QR06 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
J3QR06 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
J3QR06 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QR06 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QR06 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
J3QR06 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QR06 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QR06 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
J3QR06 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
J3QR06 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3QR06 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3QR06 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3QR06 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
J3QR06 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
J3QR06 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
J3QR06 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
J3QR06 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
J3QR06 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3QR06 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3QR06 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3QR06 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3QR06 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3QR06 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3QR06 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3QR06 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3QR06 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
J3QR06 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3QR06 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3QR06 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3QR06 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
J3QR06 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3QR06 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
J3QR06 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
J3QR06 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
J3QR06 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
J3QR06 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QR06 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QR06 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QR06 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QR06 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3QR06 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3QR06 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3QR06 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3QR06 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3QR06 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
J3QR06 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3QR06 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3QR06 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3QR06 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3QR06 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3QR06 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3QR06 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3QR06 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3QR06 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3QR06 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3QR06 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3QR06 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QR06 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QR06 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3QR06 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
J3QR06 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3QR06 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3QR06 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3QR06 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3QR06 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3QR06 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3QR06 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3QR06 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
J3QR06 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
J3QR06 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
J3QR06 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
J3QR06 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
J3QR06 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
J3QR06 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
J3QR06 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
J3QR06 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
J3QR06 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
J3QR06 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
J3QR06 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
J3QR06 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
J3QR06 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
J3QR06 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
J3QR06 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
J3QR06 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
J3QR06 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms