Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GOLGA8SH3BPF8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GOLGA8SH3BPF8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GOLGA8SH3BPF8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GOLGA8SH3BPF8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GOLGA8SH3BPF8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GOLGA8SH3BPF8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GOLGA8SH3BPF8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GOLGA8SH3BPF8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GOLGA8SH3BPF8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GOLGA8SH3BPF8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GOLGA8SH3BPF8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GOLGA8SH3BPF8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GOLGA8SH3BPF8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GOLGA8SH3BPF8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GOLGA8SH3BPF8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GOLGA8SH3BPF8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GOLGA8SH3BPF8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GOLGA8SH3BPF8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GOLGA8SH3BPF8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GOLGA8SH3BPF8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GOLGA8SH3BPF8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GOLGA8SH3BPF8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
GOLGA8SH3BPF8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
GOLGA8SH3BPF8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GOLGA8SH3BPF8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GOLGA8SH3BPF8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLGA8SH3BPF8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLGA8SH3BPF8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLGA8SH3BPF8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLGA8SH3BPF8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLGA8SH3BPF8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOLGA8SH3BPF8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOLGA8SH3BPF8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOLGA8SH3BPF8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA8SH3BPF8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA8SH3BPF8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA8SH3BPF8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GOLGA8SH3BPF8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GOLGA8SH3BPF8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GOLGA8SH3BPF8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GOLGA8SH3BPF8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GOLGA8SH3BPF8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GOLGA8SH3BPF8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GOLGA8SH3BPF8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GOLGA8SH3BPF8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GOLGA8SH3BPF8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GOLGA8SH3BPF8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GOLGA8SH3BPF8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GOLGA8SH3BPF8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GOLGA8SH3BPF8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GOLGA8SH3BPF8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GOLGA8SH3BPF8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GOLGA8SH3BPF8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GOLGA8SH3BPF8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GOLGA8SH3BPF8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GOLGA8SH3BPF8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA8SH3BPF8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA8SH3BPF8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA8SH3BPF8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA8SH3BPF8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GOLGA8SH3BPF8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GOLGA8SH3BPF8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GOLGA8SH3BPF8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GOLGA8SH3BPF8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GOLGA8SH3BPF8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA8SH3BPF8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA8SH3BPF8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA8SH3BPF8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA8SH3BPF8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA8SH3BPF8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA8SH3BPF8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA8SH3BPF8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA8SH3BPF8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA8SH3BPF8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA8SH3BPF8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA8SH3BPF8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA8SH3BPF8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA8SH3BPF8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA8SH3BPF8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA8SH3BPF8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA8SH3BPF8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA8SH3BPF8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA8SH3BPF8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA8SH3BPF8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA8SH3BPF8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA8SH3BPF8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA8SH3BPF8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA8SH3BPF8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GOLGA8SH3BPF8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GOLGA8SH3BPF8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GOLGA8SH3BPF8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GOLGA8SH3BPF8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GOLGA8SH3BPF8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GOLGA8SH3BPF8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GOLGA8SH3BPF8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GOLGA8SH3BPF8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GOLGA8SH3BPF8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GOLGA8SH3BPF8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA8SH3BPF8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms