Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PIPSLA2A3N6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PIPSLA2A3N6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PIPSLA2A3N6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PIPSLA2A3N6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PIPSLA2A3N6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PIPSLA2A3N6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIPSLA2A3N6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIPSLA2A3N6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIPSLA2A3N6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIPSLA2A3N6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PIPSLA2A3N6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIPSLA2A3N6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PIPSLA2A3N6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIPSLA2A3N6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIPSLA2A3N6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIPSLA2A3N6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIPSLA2A3N6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIPSLA2A3N6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIPSLA2A3N6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIPSLA2A3N6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIPSLA2A3N6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIPSLA2A3N6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIPSLA2A3N6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIPSLA2A3N6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIPSLA2A3N6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PIPSLA2A3N6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PIPSLA2A3N6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIPSLA2A3N6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PIPSLA2A3N6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIPSLA2A3N6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIPSLA2A3N6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIPSLA2A3N6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIPSLA2A3N6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIPSLA2A3N6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIPSLA2A3N6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PIPSLA2A3N6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PIPSLA2A3N6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PIPSLA2A3N6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PIPSLA2A3N6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIPSLA2A3N6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIPSLA2A3N6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PIPSLA2A3N6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PIPSLA2A3N6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIPSLA2A3N6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIPSLA2A3N6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIPSLA2A3N6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIPSLA2A3N6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PIPSLA2A3N6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIPSLA2A3N6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIPSLA2A3N6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIPSLA2A3N6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PIPSLA2A3N6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms