Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6B7

AP4B1, AP-4 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4B1Q9Y6B7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP4B1Q9Y6B7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP4B1Q9Y6B7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP4B1Q9Y6B7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP4B1Q9Y6B7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP4B1Q9Y6B7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP4B1Q9Y6B7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP4B1Q9Y6B7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP4B1Q9Y6B7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP4B1Q9Y6B7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP4B1Q9Y6B7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP4B1Q9Y6B7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP4B1Q9Y6B7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP4B1Q9Y6B7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP4B1Q9Y6B7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP4B1Q9Y6B7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP4B1Q9Y6B7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP4B1Q9Y6B7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP4B1Q9Y6B7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP4B1Q9Y6B7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP4B1Q9Y6B7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP4B1Q9Y6B7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP4B1Q9Y6B7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP4B1Q9Y6B7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP4B1Q9Y6B7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP4B1Q9Y6B7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP4B1Q9Y6B7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP4B1Q9Y6B7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AP4B1Q9Y6B7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AP4B1Q9Y6B7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP4B1Q9Y6B7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP4B1Q9Y6B7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP4B1Q9Y6B7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP4B1Q9Y6B7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP4B1Q9Y6B7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AP4B1Q9Y6B7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AP4B1Q9Y6B7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
AP4B1Q9Y6B7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
AP4B1Q9Y6B7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP4B1Q9Y6B7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP4B1Q9Y6B7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP4B1Q9Y6B7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP4B1Q9Y6B7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP4B1Q9Y6B7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AP4B1Q9Y6B7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AP4B1Q9Y6B7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AP4B1Q9Y6B7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP4B1Q9Y6B7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP4B1Q9Y6B7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP4B1Q9Y6B7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AP4B1Q9Y6B7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
AP4B1Q9Y6B7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP4B1Q9Y6B7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP4B1Q9Y6B7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP4B1Q9Y6B7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP4B1Q9Y6B7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP4B1Q9Y6B7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AP4B1Q9Y6B7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AP4B1Q9Y6B7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP4B1Q9Y6B7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP4B1Q9Y6B7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
AP4B1Q9Y6B7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AP4B1Q9Y6B7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AP4B1Q9Y6B7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AP4B1Q9Y6B7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AP4B1Q9Y6B7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AP4B1Q9Y6B7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AP4B1Q9Y6B7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AP4B1Q9Y6B7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AP4B1Q9Y6B7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AP4B1Q9Y6B7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AP4B1Q9Y6B7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AP4B1Q9Y6B7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AP4B1Q9Y6B7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AP4B1Q9Y6B7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AP4B1Q9Y6B7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AP4B1Q9Y6B7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AP4B1Q9Y6B7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AP4B1Q9Y6B7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AP4B1Q9Y6B7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP4B1Q9Y6B7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP4B1Q9Y6B7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AP4B1Q9Y6B7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AP4B1Q9Y6B7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP4B1Q9Y6B7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP4B1Q9Y6B7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP4B1Q9Y6B7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AP4B1Q9Y6B7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AP4B1Q9Y6B7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP4B1Q9Y6B7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP4B1Q9Y6B7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AP4B1Q9Y6B7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
AP4B1Q9Y6B7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP4B1Q9Y6B7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
AP4B1Q9Y6B7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
AP4B1Q9Y6B7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP4B1Q9Y6B7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
AP4B1Q9Y6B7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AP4B1Q9Y6B7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP4B1Q9Y6B7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms