Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
GTF3C3Q9Y5Q9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
GTF3C3Q9Y5Q9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
GTF3C3Q9Y5Q9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
GTF3C3Q9Y5Q9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
GTF3C3Q9Y5Q9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
GTF3C3Q9Y5Q9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
GTF3C3Q9Y5Q9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
GTF3C3Q9Y5Q9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.2■■■■□ 3.39
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.38
GTF3C3Q9Y5Q9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
GTF3C3Q9Y5Q9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
GTF3C3Q9Y5Q9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
GTF3C3Q9Y5Q9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
GTF3C3Q9Y5Q9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
GTF3C3Q9Y5Q9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
GTF3C3Q9Y5Q9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
GTF3C3Q9Y5Q9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
GTF3C3Q9Y5Q9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
GTF3C3Q9Y5Q9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
GTF3C3Q9Y5Q9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
GTF3C3Q9Y5Q9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
GTF3C3Q9Y5Q9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
GTF3C3Q9Y5Q9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.37
GTF3C3Q9Y5Q9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
GTF3C3Q9Y5Q9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
GTF3C3Q9Y5Q9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
GTF3C3Q9Y5Q9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
GTF3C3Q9Y5Q9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
GTF3C3Q9Y5Q9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
GTF3C3Q9Y5Q9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
GTF3C3Q9Y5Q9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
GTF3C3Q9Y5Q9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
GTF3C3Q9Y5Q9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
GTF3C3Q9Y5Q9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
GTF3C3Q9Y5Q9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
GTF3C3Q9Y5Q9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
GTF3C3Q9Y5Q9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
GTF3C3Q9Y5Q9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
GTF3C3Q9Y5Q9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
GTF3C3Q9Y5Q9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
GTF3C3Q9Y5Q9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
GTF3C3Q9Y5Q9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
GTF3C3Q9Y5Q9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
GTF3C3Q9Y5Q9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
GTF3C3Q9Y5Q9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
GTF3C3Q9Y5Q9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
GTF3C3Q9Y5Q9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
GTF3C3Q9Y5Q9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
GTF3C3Q9Y5Q9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
GTF3C3Q9Y5Q9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
GTF3C3Q9Y5Q9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
GTF3C3Q9Y5Q9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
GTF3C3Q9Y5Q9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
GTF3C3Q9Y5Q9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
GTF3C3Q9Y5Q9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
GTF3C3Q9Y5Q9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
GTF3C3Q9Y5Q9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
GTF3C3Q9Y5Q9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
GTF3C3Q9Y5Q9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
GTF3C3Q9Y5Q9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
GTF3C3Q9Y5Q9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
GTF3C3Q9Y5Q9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
GTF3C3Q9Y5Q9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
GTF3C3Q9Y5Q9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
GTF3C3Q9Y5Q9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC35.77■■■■□ 3.32
GTF3C3Q9Y5Q9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
GTF3C3Q9Y5Q9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
GTF3C3Q9Y5Q9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
GTF3C3Q9Y5Q9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
GTF3C3Q9Y5Q9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
GTF3C3Q9Y5Q9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
GTF3C3Q9Y5Q9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
GTF3C3Q9Y5Q9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
GTF3C3Q9Y5Q9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
GTF3C3Q9Y5Q9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
GTF3C3Q9Y5Q9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
GTF3C3Q9Y5Q9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
GTF3C3Q9Y5Q9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
GTF3C3Q9Y5Q9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
GTF3C3Q9Y5Q9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
GTF3C3Q9Y5Q9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms