Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PAXBP1Q9Y5B6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PAXBP1Q9Y5B6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PAXBP1Q9Y5B6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PAXBP1Q9Y5B6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PAXBP1Q9Y5B6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PAXBP1Q9Y5B6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PAXBP1Q9Y5B6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PAXBP1Q9Y5B6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PAXBP1Q9Y5B6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PAXBP1Q9Y5B6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PAXBP1Q9Y5B6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PAXBP1Q9Y5B6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PAXBP1Q9Y5B6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PAXBP1Q9Y5B6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PAXBP1Q9Y5B6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PAXBP1Q9Y5B6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PAXBP1Q9Y5B6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PAXBP1Q9Y5B6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PAXBP1Q9Y5B6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PAXBP1Q9Y5B6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PAXBP1Q9Y5B6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PAXBP1Q9Y5B6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PAXBP1Q9Y5B6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PAXBP1Q9Y5B6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PAXBP1Q9Y5B6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PAXBP1Q9Y5B6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PAXBP1Q9Y5B6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PAXBP1Q9Y5B6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PAXBP1Q9Y5B6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PAXBP1Q9Y5B6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PAXBP1Q9Y5B6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PAXBP1Q9Y5B6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PAXBP1Q9Y5B6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PAXBP1Q9Y5B6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PAXBP1Q9Y5B6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PAXBP1Q9Y5B6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PAXBP1Q9Y5B6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PAXBP1Q9Y5B6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PAXBP1Q9Y5B6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PAXBP1Q9Y5B6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PAXBP1Q9Y5B6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PAXBP1Q9Y5B6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PAXBP1Q9Y5B6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
PAXBP1Q9Y5B6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PAXBP1Q9Y5B6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PAXBP1Q9Y5B6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PAXBP1Q9Y5B6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PAXBP1Q9Y5B6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PAXBP1Q9Y5B6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PAXBP1Q9Y5B6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PAXBP1Q9Y5B6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PAXBP1Q9Y5B6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PAXBP1Q9Y5B6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PAXBP1Q9Y5B6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PAXBP1Q9Y5B6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PAXBP1Q9Y5B6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PAXBP1Q9Y5B6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PAXBP1Q9Y5B6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PAXBP1Q9Y5B6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PAXBP1Q9Y5B6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PAXBP1Q9Y5B6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PAXBP1Q9Y5B6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PAXBP1Q9Y5B6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PAXBP1Q9Y5B6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PAXBP1Q9Y5B6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PAXBP1Q9Y5B6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PAXBP1Q9Y5B6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PAXBP1Q9Y5B6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PAXBP1Q9Y5B6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PAXBP1Q9Y5B6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PAXBP1Q9Y5B6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PAXBP1Q9Y5B6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PAXBP1Q9Y5B6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PAXBP1Q9Y5B6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PAXBP1Q9Y5B6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PAXBP1Q9Y5B6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PAXBP1Q9Y5B6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PAXBP1Q9Y5B6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PAXBP1Q9Y5B6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PAXBP1Q9Y5B6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PAXBP1Q9Y5B6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PAXBP1Q9Y5B6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PAXBP1Q9Y5B6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PAXBP1Q9Y5B6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PAXBP1Q9Y5B6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PAXBP1Q9Y5B6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PAXBP1Q9Y5B6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PAXBP1Q9Y5B6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PAXBP1Q9Y5B6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PAXBP1Q9Y5B6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PAXBP1Q9Y5B6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PAXBP1Q9Y5B6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms