Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FAN1Q9Y2M0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FAN1Q9Y2M0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FAN1Q9Y2M0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FAN1Q9Y2M0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FAN1Q9Y2M0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FAN1Q9Y2M0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FAN1Q9Y2M0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FAN1Q9Y2M0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FAN1Q9Y2M0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FAN1Q9Y2M0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FAN1Q9Y2M0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FAN1Q9Y2M0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FAN1Q9Y2M0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
FAN1Q9Y2M0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
FAN1Q9Y2M0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FAN1Q9Y2M0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FAN1Q9Y2M0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FAN1Q9Y2M0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FAN1Q9Y2M0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FAN1Q9Y2M0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FAN1Q9Y2M0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
FAN1Q9Y2M0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FAN1Q9Y2M0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FAN1Q9Y2M0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FAN1Q9Y2M0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FAN1Q9Y2M0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FAN1Q9Y2M0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FAN1Q9Y2M0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FAN1Q9Y2M0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FAN1Q9Y2M0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FAN1Q9Y2M0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FAN1Q9Y2M0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FAN1Q9Y2M0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
FAN1Q9Y2M0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FAN1Q9Y2M0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FAN1Q9Y2M0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FAN1Q9Y2M0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FAN1Q9Y2M0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FAN1Q9Y2M0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FAN1Q9Y2M0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FAN1Q9Y2M0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FAN1Q9Y2M0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FAN1Q9Y2M0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
FAN1Q9Y2M0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FAN1Q9Y2M0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FAN1Q9Y2M0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FAN1Q9Y2M0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FAN1Q9Y2M0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FAN1Q9Y2M0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FAN1Q9Y2M0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FAN1Q9Y2M0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FAN1Q9Y2M0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FAN1Q9Y2M0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FAN1Q9Y2M0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FAN1Q9Y2M0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FAN1Q9Y2M0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FAN1Q9Y2M0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FAN1Q9Y2M0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
FAN1Q9Y2M0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FAN1Q9Y2M0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FAN1Q9Y2M0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FAN1Q9Y2M0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FAN1Q9Y2M0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FAN1Q9Y2M0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FAN1Q9Y2M0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FAN1Q9Y2M0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FAN1Q9Y2M0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FAN1Q9Y2M0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FAN1Q9Y2M0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FAN1Q9Y2M0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FAN1Q9Y2M0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FAN1Q9Y2M0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FAN1Q9Y2M0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
FAN1Q9Y2M0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FAN1Q9Y2M0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FAN1Q9Y2M0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FAN1Q9Y2M0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FAN1Q9Y2M0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FAN1Q9Y2M0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FAN1Q9Y2M0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FAN1Q9Y2M0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FAN1Q9Y2M0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FAN1Q9Y2M0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FAN1Q9Y2M0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FAN1Q9Y2M0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FAN1Q9Y2M0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FAN1Q9Y2M0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FAN1Q9Y2M0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FAN1Q9Y2M0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FAN1Q9Y2M0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FAN1Q9Y2M0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
FAN1Q9Y2M0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FAN1Q9Y2M0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FAN1Q9Y2M0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FAN1Q9Y2M0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FAN1Q9Y2M0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FAN1Q9Y2M0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FAN1Q9Y2M0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FAN1Q9Y2M0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms