Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF6Q9Y252 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF6Q9Y252 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF6Q9Y252 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF6Q9Y252 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF6Q9Y252 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF6Q9Y252 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF6Q9Y252 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF6Q9Y252 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF6Q9Y252 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF6Q9Y252 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF6Q9Y252 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF6Q9Y252 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF6Q9Y252 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF6Q9Y252 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF6Q9Y252 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF6Q9Y252 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF6Q9Y252 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF6Q9Y252 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF6Q9Y252 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF6Q9Y252 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF6Q9Y252 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF6Q9Y252 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF6Q9Y252 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF6Q9Y252 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF6Q9Y252 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF6Q9Y252 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF6Q9Y252 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF6Q9Y252 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF6Q9Y252 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF6Q9Y252 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF6Q9Y252 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF6Q9Y252 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF6Q9Y252 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF6Q9Y252 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF6Q9Y252 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF6Q9Y252 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF6Q9Y252 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF6Q9Y252 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF6Q9Y252 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF6Q9Y252 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF6Q9Y252 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF6Q9Y252 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF6Q9Y252 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF6Q9Y252 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF6Q9Y252 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF6Q9Y252 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF6Q9Y252 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF6Q9Y252 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF6Q9Y252 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF6Q9Y252 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF6Q9Y252 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF6Q9Y252 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF6Q9Y252 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF6Q9Y252 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF6Q9Y252 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF6Q9Y252 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF6Q9Y252 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF6Q9Y252 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF6Q9Y252 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF6Q9Y252 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF6Q9Y252 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF6Q9Y252 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF6Q9Y252 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF6Q9Y252 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF6Q9Y252 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF6Q9Y252 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF6Q9Y252 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF6Q9Y252 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF6Q9Y252 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF6Q9Y252 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF6Q9Y252 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF6Q9Y252 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF6Q9Y252 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF6Q9Y252 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF6Q9Y252 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF6Q9Y252 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF6Q9Y252 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF6Q9Y252 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF6Q9Y252 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RNF6Q9Y252 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF6Q9Y252 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF6Q9Y252 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF6Q9Y252 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF6Q9Y252 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF6Q9Y252 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF6Q9Y252 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF6Q9Y252 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF6Q9Y252 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF6Q9Y252 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF6Q9Y252 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF6Q9Y252 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF6Q9Y252 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF6Q9Y252 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF6Q9Y252 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF6Q9Y252 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF6Q9Y252 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF6Q9Y252 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF6Q9Y252 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF6Q9Y252 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms