Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TNNQ9UQP3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TNNQ9UQP3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TNNQ9UQP3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TNNQ9UQP3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TNNQ9UQP3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TNNQ9UQP3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TNNQ9UQP3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TNNQ9UQP3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TNNQ9UQP3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TNNQ9UQP3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TNNQ9UQP3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TNNQ9UQP3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TNNQ9UQP3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TNNQ9UQP3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
TNNQ9UQP3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TNNQ9UQP3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TNNQ9UQP3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TNNQ9UQP3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TNNQ9UQP3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TNNQ9UQP3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
TNNQ9UQP3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
TNNQ9UQP3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
TNNQ9UQP3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
TNNQ9UQP3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TNNQ9UQP3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TNNQ9UQP3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TNNQ9UQP3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TNNQ9UQP3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TNNQ9UQP3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TNNQ9UQP3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TNNQ9UQP3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TNNQ9UQP3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TNNQ9UQP3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TNNQ9UQP3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TNNQ9UQP3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
TNNQ9UQP3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TNNQ9UQP3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TNNQ9UQP3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TNNQ9UQP3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TNNQ9UQP3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TNNQ9UQP3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TNNQ9UQP3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TNNQ9UQP3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TNNQ9UQP3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TNNQ9UQP3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
TNNQ9UQP3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TNNQ9UQP3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TNNQ9UQP3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TNNQ9UQP3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TNNQ9UQP3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TNNQ9UQP3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TNNQ9UQP3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TNNQ9UQP3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TNNQ9UQP3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TNNQ9UQP3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TNNQ9UQP3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TNNQ9UQP3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TNNQ9UQP3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TNNQ9UQP3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TNNQ9UQP3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TNNQ9UQP3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TNNQ9UQP3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TNNQ9UQP3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TNNQ9UQP3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TNNQ9UQP3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TNNQ9UQP3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
TNNQ9UQP3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.81■■■■□ 3
TNNQ9UQP3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TNNQ9UQP3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TNNQ9UQP3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TNNQ9UQP3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
TNNQ9UQP3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TNNQ9UQP3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TNNQ9UQP3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TNNQ9UQP3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TNNQ9UQP3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TNNQ9UQP3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TNNQ9UQP3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TNNQ9UQP3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TNNQ9UQP3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TNNQ9UQP3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TNNQ9UQP3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TNNQ9UQP3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TNNQ9UQP3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TNNQ9UQP3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TNNQ9UQP3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
TNNQ9UQP3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TNNQ9UQP3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TNNQ9UQP3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TNNQ9UQP3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
TNNQ9UQP3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TNNQ9UQP3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TNNQ9UQP3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TNNQ9UQP3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TNNQ9UQP3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TNNQ9UQP3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TNNQ9UQP3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
TNNQ9UQP3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TNNQ9UQP3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms